HTR3A

HTR3A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4PIR
Ідентифікатори
Символи	HTR3A, 5-HT-3, 5-HT3A, 5-HT3R, 5HT3R, HTR3, 5-hydroxytryptamine receptor 3A
Зовнішні ІД	OMIM: 182139 MGI: 96282 HomoloGene: 671 GeneCards: HTR3A
Реагує на сполуку
	2-methyl-5-HT, Серотонін, 1-(3-chlorophenyl)biguanide, quipazine, алосетрон, azasetron, cilansetron, кокаїн, метоклопрамід, ондансетрон, ramosetron, tubocurarine, Вортіоксетин, bilobalide, дилтіазем[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • ligand-gated ion channel activity; • serotonin binding; • extracellular ligand-gated ion channel activity; • serotonin-gated cation-selective channel activity; • ion channel activity; • transmembrane signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • postsynaptic membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • синапс; • Аксон; • Міжклітинні контакти; • neuronal cell body; • serotonin-activated cation-selective channel complex; • cleavage furrow; • glutamatergic synapse; • integral component of postsynaptic membrane; • integral component of presynaptic membrane; • integral component of plasma membrane; • neuron projection;
Біологічний процес	• response to cocaine; • cellular response to growth factor stimulus; • ion transport; • response to ethanol; • positive regulation of ion transmembrane transporter activity; • Сигнальна трансдукція; • ion transmembrane transport; • serotonin receptor signaling pathway; • chemical synaptic transmission; • regulation of membrane potential; • nervous system process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3359
	15561
	ENSG00000166736
	ENSMUSG00000032269
	P46098
	P23979
	NM_000869; NM_001161772; NM_213621
	NM_001099644; NM_013561
	NP_000860; NP_001155244; NP_998786
	NP_001093114; NP_038589
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HTR3A (англ. 5-hydroxytryptamine receptor 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 55 280[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLWVQQALL	ALLLPTLLAQ	GEARRSRNTT	RPALLRLSDY	LLTNYRKGVR
PVRDWRKPTT	VSIDVIVYAI	LNVDEKNQVL	TTYIWYRQYW	TDEFLQWNPE
DFDNITKLSI	PTDSIWVPDI	LINEFVDVGK	SPNIPYVYIR	HQGEVQNYKP
LQVVTACSLD	IYNFPFDVQN	CSLTFTSWLH	TIQDINISLW	RLPEKVKSDR
SVFMNQGEWE	LLGVLPYFRE	FSMESSNYYA	EMKFYVVIRR	RPLFYVVSLL
LPSIFLMVMD	IVGFYLPPNS	GERVSFKITL	LLGYSVFLII	VSDTLPATAI
GTPLIGVYFV	VCMALLVISL	AETIFIVRLV	HKQDLQQPVP	AWLRHLVLER
IAWLLCLREQ	STSQRPPATS	QATKTDDCSA	MGNHCSHMGG	PQDFEKSPRD
RCSPPPPPRE	ASLAVCGLLQ	ELSSIRQFLE	KRDEIREVAR	DWLRVGSVLD
KLLFHIYLLA	VLAYSITLVM	LWSIWQYA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Bruess M., Goethert M., Hayer M., Bonisch H. (1998). Molecular cloning of alternatively spliced human 5HT3 receptor cDNAs.. Ann. N. Y. Acad. Sci. 861: 234 — 235. PubMed DOI:10.1111/j.1749-6632.1998.tb10196.x
Bruess M., Eucker T., Goethert M., Bonisch H. (2000). Exon-intron organization of the human 5-HT3A receptor gene.. Neuropharmacology 39: 308 — 315. PubMed DOI:10.1016/S0028-3908(99)00116-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kelley S.P., Dunlop J.I., Kirkness E.F., Lambert J.J., Peters J.A. (2003). A cytoplasmic region determines single-channel conductance in 5-HT3 receptors.. Nature 424: 321 — 324. PubMed DOI:10.1038/nature01788
Cheng A., McDonald N.A., Connolly C.N. (2005). Cell surface expression of 5-hydroxytryptamine type 3 receptors is promoted by RIC-3.. J. Biol. Chem. 280: 22502 — 22507. PubMed DOI:10.1074/jbc.M414341200
Miyake A., Mochizuki S., Takemoto Y., Akuzawa S. (1995). Molecular cloning of human 5-hydroxytryptamine3 receptor: heterogeneity in distribution and function among species.. Mol. Pharmacol. 48: 407 — 416. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з 5-hydroxytryptamine receptor 3A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5297 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P46098 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з 5-hydroxytryptamine receptor 3A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5297 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P46098 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.