LIG1

LIG1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1X9N
Ідентифікатори
Символи	LIG1, DNA ligase 1, LIGI, hLig1
Зовнішні ІД	OMIM: 126391 MGI: 101789 HomoloGene: 197 GeneCards: LIG1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • DNA ligase (ATP) activity; • зв'язування з іоном металу; • ligase activity; • ATP binding; • DNA ligase activity;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • Нуклеоплазма; • мітохондрія; • клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair, DNA gap filling; • DNA recombination; • DNA biosynthetic process; • anatomical structure morphogenesis; • Okazaki fragment processing involved in mitotic DNA replication; • cellular response to DNA damage stimulus; • поділ клітини; • Реплікація ДНК; • V(D)J-рекомбінація; • mismatch repair; • DNA ligation involved in DNA repair; • клітинний цикл; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • Репарація ДНК; • base-excision repair; • DNA ligation; • lagging strand elongation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3978
	16881
	ENSG00000105486
	ENSMUSG00000056394
	P18858
	P37913
	NM_000234; NM_001289063; NM_001289064; NM_001320970; NM_001320971
	NM_001083188; NM_001199310; NM_010715
	NP_000225; NP_001275992; NP_001275993; NP_001307899; NP_001307900
	NP_001076657; NP_001186239; NP_034845
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LIG1 (англ. DNA ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 101 736[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRSIMSFFH	PKKEGKAKKP	EKEASNSSRE	TEPPPKAALK	EWNGVVSESD
SPVKRPGRKA	ARVLGSEGEE	EDEALSPAKG	QKPALDCSQV	SPPRPATSPE
NNASLSDTSP	MDSSPSGIPK	RRTARKQLPK	RTIQEVLEEQ	SEDEDREAKR
KKEEEEEETP	KESLTEAEVA	TEKEGEDGDQ	PTTPPKPLKT	SKAETPTESV
SEPEVATKQE	LQEEEEQTKP	PRRAPKTLSS	FFTPRKPAVK	KEVKEEEPGA
PGKEGAAEGP	LDPSGYNPAK	NNYHPVEDAC	WKPGQKVPYL	AVARTFEKIE
EVSARLRMVE	TLSNLLRSVV	ALSPPDLLPV	LYLSLNHLGP	PQQGLELGVG
DGVLLKAVAQ	ATGRQLESVR	AEAAEKGDVG	LVAENSRSTQ	RLMLPPPPLT
ASGVFSKFRD	IARLTGSAST	AKKIDIIKGL	FVACRHSEAR	FIARSLSGRL
RLGLAEQSVL	AALSQAVSLT	PPGQEFPPAM	VDAGKGKTAE	ARKTWLEEQG
MILKQTFCEV	PDLDRIIPVL	LEHGLERLPE	HCKLSPGIPL	KPMLAHPTRG
ISEVLKRFEE	AAFTCEYKYD	GQRAQIHALE	GGEVKIFSRN	QEDNTGKYPD
IISRIPKIKL	PSVTSFILDT	EAVAWDREKK	QIQPFQVLTT	RKRKEVDASE
IQVQVCLYAF	DLIYLNGESL	VREPLSRRRQ	LLRENFVETE	GEFVFATSLD
TKDIEQIAEF	LEQSVKDSCE	GLMVKTLDVD	ATYEIAKRSH	NWLKLKKDYL
DGVGDTLDLV	VIGAYLGRGK	RAGRYGGFLL	ASYDEDSEEL	QAICKLGTGF
SDEELEEHHQ	SLKALVLPSP	RPYVRIDGAV	IPDHWLDPSA	VWEVKCADLS
LSPIYPAARG	LVDSDKGISL	RFPRFIRVRE	DKQPEQATTS	AQVACLYRKQ
SQIQNQQGED	SGSDPEDTY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Petrini J.H.J., Huwiler K.G., Weaver D.T. (1991). A wild-type DNA ligase I gene is expressed in Bloom's syndrome cells.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7615 — 7619. PubMed DOI:10.1073/pnas.88.17.7615
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240
Pascal J.M., O'Brien P.J., Tomkinson A.E., Ellenberger T. (2004). Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA.. Nature 432: 473 — 478. PubMed DOI:10.1038/nature03082
Barnes D.E., Tomkinson A.E., Lehmann A.R., Webster A.D.B., Lindahl T. (1992). Mutations in the DNA ligase I gene of an individual with immunodeficiencies and cellular hypersensitivity to DNA-damaging agents.. Cell 69: 495 — 503. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(92)90450-Q

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6598 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P18858 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6598 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P18858 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.