RAF1

RAF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1C1Y, 1FAQ, 1FAR, 1GUA, 1RFA, 3CU8, 3IQJ, 3IQU, 3IQV, 3KUC, 3KUD, 3NKX, 3O8I, 3OMV, 4FJ3, 4G0N, 4G3X, 4IEA, 4IHL
Ідентифікатори
Символи	RAF1, Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase, CMD1NN, CRAF, NS5, Raf-1, c-Raf
Зовнішні ІД	OMIM: 164760 MGI: 97847 HomoloGene: 48145 GeneCards: RAF1
Пов'язані генетичні захворювання
	гіпертрофічна кардіоміопатія, Noonan syndrome 5, dilated cardiomyopathy 1NN[1]
Реагує на сполуку
	сорафеніб, вемурафеніб[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • зв'язування з іоном металу; • protein serine/threonine kinase activity; • small GTPase binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • ATP binding; • kinase activity; • MAP kinase kinase kinase activity; • enzyme binding; • mitogen-activated protein kinase kinase binding; • adenylate cyclase binding; • adenylate cyclase activator activity; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • Псевдоподія; • мембрана; • клітинна мембрана; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • мітохондрія; • клітинне ядро; • nuclear speck; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• response to muscle stretch; • regulation of apoptotic process; • Диференціація клітин; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of protein phosphorylation; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • response to hypoxia; • somatic stem cell population maintenance; • фосфорилювання; • thymus development; • cellular glucose homeostasis; • negative regulation of protein-containing complex assembly; • Загоєння ран; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • negative regulation of apoptotic process; • MAPK cascade; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • regulation of cell motility; • platelet activation; • protein phosphorylation; • heart development; • thyroid gland development; • ion transmembrane transport; • face development; • death-inducing signaling complex assembly; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • intermediate filament cytoskeleton organization; • regulation of cell differentiation; • проліферація; • regulation of Rho protein signal transduction; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • Апоптоз; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • multicellular organism development; • negative regulation of signal transduction; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • activation of adenylate cyclase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5894
	110157
	ENSG00000132155
	ENSMUSG00000000441
	P04049
	Q99N57
	NM_002880
	NM_029780; NM_001356333; NM_001356334
NP_002871; NP_001341618; NP_001341619; NP_001341620; NP_001341621;
	NP_001341622; NP_001341624; NP_001341623
	NP_084056; NP_001343262; NP_001343263
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAF1 (англ. Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 648 амінокислот, а молекулярна маса — 73 052[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEHIQGAWKT	ISNGFGFKDA	VFDGSSCISP	TIVQQFGYQR	RASDDGKLTD
PSKTSNTIRV	FLPNKQRTVV	NVRNGMSLHD	CLMKALKVRG	LQPECCAVFR
LLHEHKGKKA	RLDWNTDAAS	LIGEELQVDF	LDHVPLTTHN	FARKTFLKLA
FCDICQKFLL	NGFRCQTCGY	KFHEHCSTKV	PTMCVDWSNI	RQLLLFPNST
IGDSGVPALP	SLTMRRMRES	VSRMPVSSQH	RYSTPHAFTF	NTSSPSSEGS
LSQRQRSTST	PNVHMVSTTL	PVDSRMIEDA	IRSHSESASP	SALSSSPNNL
SPTGWSQPKT	PVPAQRERAP	VSGTQEKNKI	RPRGQRDSSY	YWEIEASEVM
LSTRIGSGSF	GTVYKGKWHG	DVAVKILKVV	DPTPEQFQAF	RNEVAVLRKT
RHVNILLFMG	YMTKDNLAIV	TQWCEGSSLY	KHLHVQETKF	QMFQLIDIAR
QTAQGMDYLH	AKNIIHRDMK	SNNIFLHEGL	TVKIGDFGLA	TVKSRWSGSQ
QVEQPTGSVL	WMAPEVIRMQ	DNNPFSFQSD	VYSYGIVLYE	LMTGELPYSH
INNRDQIIFM	VGRGYASPDL	SKLYKNCPKA	MKRLVADCVK	KVKEERPLFP
QILSSIELLQ	HSLPKINRSA	SEPSLHRAAH	TEDINACTLT	TSPRLPVF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, cерин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zimmermann S., Moelling K. (1999). Phosphorylation and regulation of Raf by Akt (protein kinase B).. Science 286: 1741 — 1744. PubMed DOI:10.1126/science.286.5445.1741
Chong H., Lee J., Guan K.L. (2001). Positive and negative regulation of Raf kinase activity and function by phosphorylation.. EMBO J. 20: 3716 — 3727. PubMed DOI:10.1093/emboj/20.14.3716
Chen J., Fujii K., Zhang L., Roberts T., Fu H. (2001). Raf-1 promotes cell survival by antagonizing apoptosis signal-regulating kinase 1 through a MEK-ERK independent mechanism.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 7783 — 7788. PubMed DOI:10.1073/pnas.141224398
Zang M., Hayne C., Luo Z. (2002). Interaction between active Pak1 and Raf-1 is necessary for phosphorylation and activation of Raf-1.. J. Biol. Chem. 277: 4395 — 4405. PubMed DOI:10.1074/jbc.M110000200
Kunapuli P., Kasyapa C.S., Hawthorn L., Cowell J.K. (2004). LGI1, a putative tumor metastasis suppressor gene, controls in vitro invasiveness and expression of matrix metalloproteinases in glioma cells through the ERK1/2 pathway.. J. Biol. Chem. 279: 23151 — 23157. PubMed DOI:10.1074/jbc.M314192200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з RAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з RAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9829 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P04049 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з RAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9829 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P04049 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.