SYNE2

SYNE2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4DXS, 4FI9
Ідентифікатори
Символи	SYNE2, EDMD5, NUA, NUANCE, Nesp2, Nesprin-2, SYNE-2, TROPH, spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, KASH2
Зовнішні ІД	OMIM: 608442 MGI: 2449316 HomoloGene: 56700 GeneCards: SYNE2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin filament binding; • GO:0001948 protein binding; • actin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • Ядерна мембрана; • nuclear envelope; • мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • sarcoplasmic reticulum; • Нуклеоплазма; • aggresome; • Міжклітинні контакти; • Міофібрила; • Z disc; • meiotic nuclear membrane microtubule tethering complex; • мітохондрія; • sarcoplasmic reticulum membrane; • intermediate filament cytoskeleton; • nuclear lumen; • Екзосома; • nuclear outer membrane; • lamellipodium membrane; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • filopodium membrane; • центросома;
Біологічний процес	• fibroblast migration; • nuclear envelope organization; • nuclear migration along microfilament; • positive regulation of cell migration; • centrosome localization; • nuclear migration; • establishment or maintenance of cell polarity; • protein localization to nucleus; • nucleokinesis involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration; • regulation of cilium assembly; • centriole-centriole cohesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23224
	319565
	ENSG00000054654
	ENSMUSG00000063450
	Q8WXH0
	Q6ZWQ0
	NM_015180; NM_182910; NM_182912; NM_182913; NM_182914
	NM_001005510
	NP_055995; NP_878914; NP_878917; NP_878918
	NP_001005510
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SYNE2 (англ. Spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 6 885 амінокислот, а молекулярна маса — 796 442[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASSPELPTE	DEQGSWGIDD	LHISLQAEQE	DTQKKAFTCW	INSQLARHTS
PSVISDLFTD	IKKGHVLLDL	LEVLSGQQLP	RDKGSNTFQC	RINIEHALTF
LRNRSIKLIN	IHVTDIIDGN	PSIILGLIWT	IILHFHIEKL	AQTLSCNYNQ
PSLDDVSVVD	SSPASSPPAK	KCSKVQARWQ	MSARKALLLW	AQEQCATYES
VNVTDFKSSW	RNGMAFLAII	HALRPDLIDM	KSVKHRSNKD	NLREAFRIAE
QELKIPRLLE	PEDVDVVDPD	EKSIMTYVAQ	FLQYSKDAPG	TGEEAQGKVK
DAMGWLTLQK	EKLQKLLKDS	ENDTYFKKYN	SLLSFMESFN	EEKKSFLDVL
SIKRDLDELD	KDHLQLREAW	DGLDHQINAW	KIKLNYALPP	PLHQTEAWLQ
EVEELMDEDL	SASQDHSQAV	TLIQEKMTLF	KSLMDRFEHH	SNILLTFENK
DENHLPLVPP	NKLEEMKRRI	NNILEKKFIL	LLEFHYYKCL	VLGLVDEVKS
KLDIWNIKYG	SRESVELLLE	DWHKFIEEKE	FLARLDTSFQ	KCGEIYKNLA
GECQNINKQY	MMVKSDVCMY	RKNIYNVKST	LQKVLACWAT	YVENLRLLRA
CFEETKKEEI	KEVPFETLAQ	WNLEHATLNE	AGNFLVEVSN	DVVGSSISKE
LRRLNKRWRK	LVSKTQLEMN	LPLMIKKQDQ	PTFDNSGNIL	SKEEKATVEF
STDMSVELPE	NYNQNIKAGE	KHEKENEEFT	GQLKVAKDVE	KLIGQVEIWE
AEAKSVLDQD	DVDTSMEESL	KHLIAKGSMF	DELMARSEDM	LQMDIQNISS
QESFQHVLTT	GLQAKIQEAK	EKVQINVVKL	IAALKNLTDV	SPDLDIRLKM
EESQKELESY	MMRAQQLLGQ	RESPGELISK	HKEALIISNT	KSLAKYLKAV
EELKNNVTED	IKMSLEEKSR	DVCAKWESLH	HELSLYVQQL	KIDIEKGKLS
DNILKLEKQI	NKEKKLIRRG	RTKGLIKEHE	ACFSEEGCLY	QLNHHMEVLR
ELCEELPSQK	SQQEVKRLLK	DYEQKIERLL	KCASEIHMTL	QPTAGGTSKN
EGTITTSENR	GGDPHSEAPF	AKSDNQPSTE	KAMEPTMKFS	LASVLRPLQE
ESIMEKDYSA	SINSLLERYD	TYRDILEHHL	QNNKFRITSD	FSSEEDRSSS
CLQAKLTDLQ	VIKNETDARW	KEFEIISLKL	ENHVNDIKKP	FVIKERDTLK
ERERELQMTL	NTRMESLETA	LRLVLPVEKA	SLLLCGSDLP	LHKMAIQGFH
LIDADRIYQH	LRNIQDSIAK	QIEICNRLEE	PGNFVLKELH	PFDLHAMQNI
ILKYKTQFEG	MNHRVQRSED	TLKALEDFLA	SLRTAKLSAE	PVTDLSASDT
QVAQENTLTV	KNKEGEIHLM	KDKAKHLDKC	LKMLDMSFKD	AERGDDTSCE
NLLDAFSIKL	SETHGYGVQE	EFTEENKLLE	ACIFKNNELL	KNIQDVQSQI
SKIGLKDPTV	PAVKHRKKSL	IRLDKVLDEY	EEEKRHLQEM	ANSLPHFKDG
REKTVNQQCQ	NTVVLWENTK	ALVTECLEQC	GRVLELLKQY	QNFKSILTTL
IQKEESVISL	QASYMGKENL	KKRIAEIEIV	KEEFNEHLEV	VDKINQVCKN
LQFYLNKMKT	FEEPPFEKEA	NIIVDRWLDI	NEKTEDYYEN	LGRALALWDK
LFNLKNVIDE	WTEKALQKME	LHQLTEEDRE	RLKEELQVHE	QKTSEFSRRV
AEIQFLLQSS	EIPLELQVME	SSILNKMEHV	QKCLTGESNC	HALSGSTAEL
REDLDQAKTQ	IGMTESLLKA	LSPSDSLEIF	TKLEEIQQQI	LQQKHSMILL
ENQIGCLTPE	LSELKKQYES	VSDLFNTKKS	VLQDHFSKLL	NDQCKNFNDW
FSNIKVNLKE	CFESSETKKS	VEQKLQKLSD	FLTLEGRNSK	IKQVDSVLKH
VKKHLPKAHV	KELISWLVGQ	EFELEKMESI	CQARAKELED	SLQQLLRLQD
DHRNLRKWLT	NQEEKWKGME	EPGEKTELFC	QALARKREQF	ESVAQLNNSL
KEYGFTEEEE	IIMEATCLMD	RYQTLLRQLS	EIEEEDKLLP	TEDQSFNDLA
HDVIHWIKEI	KESLMVLNSS	EGKMPLEERI	QKIKEIILLK	PEGDARIETI
MKQAESSEAP	LVQKTLTDIS	NQWDNTLHLA	STYLSHQEKL	LLEGEKYLQS
KEDLRLMLIE	LKKKQEAGFA	LQHGLQEKKA	QLKIYKKFLK	KAQDLTSLLK
ELKSQGNYLL	ECTKNPSFSE	EPWLEIKHLH	ESLLQQLQDS	VQNLDGHVRE
HDSYQVCVTD	LNTTLDNFSK	EFVSFSDKPV	DQIAVEEKLQ	KLQELENRLS
LQDGTLKKIL	ALAKSVKQNT	SSVGQKIIKD	DIKSLQCKQK	DLENRLASAK
QEMECCLNSI	LKSKRSTEKK	GKFTLPGREK	QATSDVQEST	QESAAVEKLE
EDWEINKDSA	VEMAMSKQLS	LNAQESMKNT	EDERKVNELQ	NQPLELDTML
RNEQLEEIEK	LYTQLEAKKA	AIKPLEQTEC	LNKTETGALV	LHNIGYSAQH
LDNLLQALIT	LKKNKESQYC	VLRDFQEYLA	AVESSMKALL	TDKESLKVGP
LDSVTYLDKI	KKFIASIEKE	KDSLGNLKIK	WENLSNHVTD	MDKKLLESQI
KQLEHGWEQV	EQQIQKKYSQ	QVVEYDEFTT	LMNKVQDTEI	SLQQQQQHLQ
LRLKSPEERA	GNQSMIALTT	DLQATKHGFS	VLKGQAELQM	KRIWGEKEKK
NLEDGINNLK	KQWETLEPLH	LEAENQIKKC	DIRNKMKETI	LWAKNLLGEL
NPSIPLLPDD	ILSQIRKCKV	THDGILARQQ	SVESLAEEVK	DKVPSLTTYE
GSDLNNTLED	LRNQYQMLVL	KSTQRSQQLE	FKLEERSNFF	AIIRKFQLMV
QESETLIIPR	VETAATEAEL	KHHHVTLEAS	QKELQEIDSG	ISTHLQELTN
IYEELNVFER	LFLEDQLKNL	KIRTNRIQRF	IQNTCNEVEH	KIKFCRQFHE
KTSALQEEAD	SIQRNELLLN	QEVNKGVKEE	IYNLKDRLTA	IKCCILQVLK
LKKVFDYIGL	NWDFSQLDQL	QTQVFEKEKE	LEEKIKQLDT	FEEEHGKYQA
LLSKMRAIDL	QIKKMTEVVL	KAPDSSPESR	RLNAQILSQR	IEKAKCLCDE
IIKKLNENKT	FDDSFKEKEI	LQIKLNAEEN	DKLYKVLQNM	VLELSPKELD
EKNCQDKLET	SLHVLNQIKS	QLQQPLLINL	EIKHIQNEKD	NCEAFQEQVW
AEMCSIKAVT	AIEKQREENS	SEASDVETKL	REFEDLQMQL	NTSIDLRTNV
LNDAYENLTR	YKEAVTRAVE	SITSLEAIII	PYRVDVGNPE	ESLEMPLRKQ
EELESTVAHI	QDLTEKLGMI	SSPEAKLQLQ	YTLQELVSKN	SAMKEAFKAQ
ETEAERYLEN	YKCYRKMEED	IYTNLSKMET	VLGQSMSSLP	LSYREALERL
EQSKALVSNL	ISTKEELMKL	RQILRLLRLR	CTENDGICLL	KIVSALWEKW
LSLLEAAKEW	EMWCEELKQE	WKFVSEEIER	EAIILDNLQE	ELPEISKTKE
AATTEELSEL	LDCLCQYGEN	VEKQQLLLTL	LLQRIRSIQN	VPESSGAVET
VPAFQEITSM	KERCNKLLQK	VQKNKELVQT	EIQERHSFTK	EIIALKNFFQ
QTTTSFQNMA	FQDHPEKSEQ	FEELQSILKK	GKLTFENIME	KLRIKYSEMY
TIVPAEIESQ	VEECRKALED	IDEKISNEVL	KSSPSYAMRR	KIEEINNGLH
NVEKMLQQKS	KNIEKAQEIQ	KKMWDELDLW	HSKLNELDSE	VQDIVEQDPG
QAQEWMDNLM	IPFQQYQQVS	QRAECRTSQL	NKATVKMEEY	SDLLKSTEAW
IENTSHLLAN	PADYDSLRTL	SHHASTVQMA	LEDSEQKHNL	LHSIFMDLED
LSIIFETDEL	TQSIQELSNQ	VTALQQKIME	SLPQIQRMAD	DVVAIESEVK
SMEKRVSKIK	TILLSKEIFD	FSPEEHLKHG	EVILENIRPM	KKTIAEIVSY
QVELRLPQTG	MKPLPVFQRT	NQLLQDIKLL	ENVTQEQNEL	LKVVIKQTNE
WDEEIENLKQ	ILNNYSAQFS	LEHMSPDQAD	KLPQLQGEIE	RMEKQILSLN
QRKEDLLVDL	KATVLNLHQH	LKQEQEGVER	DRLPAVTSEE	GGVAERDASE
RKLNRRGSMS	YLAAVEEEVE	ESSVKSDNGD	EKAEPSPQSW	SSLWKHDKDM
EEDRASSSSG	TIVQEAYGKI	STSDNSMAQI	LTPDSLNTEQ	GPECSLRPNQ
TEEGTTPPIE	ADTLDSSDAQ	GGLEPRVEKT	RPEPTEVLHA	CKTQVAELEL
WLQQANVAVE	PETLNADMQQ	VLEQQLVGCQ	AMLTEIEHKV	AFLLETCKDQ
GLGDNGATQH	EAEALSLKLK	TVKCNLEKVQ	MMLQEKHSED	QHPTILKKSS
EPEHQEALQP	VNLSELESIV	TERPQFSRQK	DFQQQQVLEL	KPMEQKDFIK
FIEFNAKKMW	PQYCQHDNDT	TQESSASNQA	SSPENDVPDS	ILSPQGQNGD
KWQYLHHELS	SKIKLPLPQL	VEPQVSTNMG	ILPSVTMYNF	RYPTTEELKT
YTTQLEDLRQ	EASNLQTQEN	MTEEAYINLD	KKLFELFLTL	SQCLSSVEEM
LEMPRLYRED	GSGQQVHYET	LALELKKLYL	ALSDKKGDLL	KAMTWPGENT
NLLLECFDNL	QVCLEHTQAA	AVCRSKSLKA	GLDYNRSYQN	EIKRLYHQLI
KSKTSLQQSL	NEISGQSVAE	QLQKADAYTV	ELENAESRVA	KLRDEGERLH
LPYALLQEVY	KLEDVLDSMW	GMLRARYTEL	SSPFVTESQQ	DALLQGMVEL
VKIGKEKLAH	GHLKQTKSKV	ALQAQIENHK	VFFQKLVADM	LLIQAYSAKI
LPSLLQNRET	FWAEQVTEVK	ILEEKSRQCG	MKLQSLLQKW	EEFDENYASL
EKDLEILIST	LPSVSLVEET	EERLVERISF	YQQIKRNIGG	KHARLYQTLN
EGKQLVASVS	CPELEGQIAK	LEEQWLSLNK	KIDHELHRLQ	ALLKHLLSYN
RDSDQLTKWL	ESSQHTLNYW	KEQSLNVSQD	LDTIRSNINN	FFEFSKEVDE
KSSLKTAVIS	IGNQLLHLKE	TDTATLRASL	AQFEQKWTML	ITQLPDIQEK
LHQLQMEKLP	SRKAITEMIS	WMNNVEHQTS	DEDSVHSPSS	ASQVKHLLQK
HKEFRMEMDY	KQWIVDFVNQ	SLLQLSTCDV	ESKRYERTEF	AEHLGEMNRQ
WHRVHGMLNR	KIQHLEQLLE	SITESENKIQ	ILNNWLEAQE	ERLKTLQKPE
SVISVQKLLL	DCQDIENQLA	IKSKALDELK	QSYLTLESGA	VPLLEDTASR
IDELFQKRSS	VLTQVNQLKT	SMQSVLQEWK	IYDQLYDEVN	MMTIRFWYCM
EHSKPVVLSL	ETLRCQVENL	QSLQDEAESS	EGSWEKLQEV	IGKLKGLCPS
VAEIIEEKCQ	NTHKRWTQVN	QAIADQLQKA	QSLLQLWKAY	SNAHGEAAAR
LKQQEAKFQQ	LANISMSGNN	LAEILPPALQ	DIKELQHDVQ	KTKEAFLQNS
SVLDRLPQPA	ESSTHMLLPG	PLHSLQRAAY	LEKMLLVKAN	EFEFVLSQFK
DFGVRLESLK	GLIMHEEENL	DRLHQQEKEN	PDSFLNHVLA	LTAQSPDIEH
LNEVSLKLPL	SDVAVKTLQN	MNRQWIRATA	TALERCSELQ	GIGLNEKFLY
CCEKWIQLLE	KIEEALKVDV	ANSLPELLEQ	QKTYKMLEAE	VSINQTIADS
YVTQSLQLLD	TTEIENRPEF	ITEFSKLTDR	WQNAVQGVRQ	RKGDVDGLVR
QWQDFTTSVE	NLFRFLTDTS	HLLSAVKGQE	RFSLYQTRSL	IHELKNKEIH
FQRRRTTCAL	TLEAGEKLLL	TTDLKTKESV	GRRISQLQDS	WKDMEPQLAE
MIKQFQSTVE	TWDQCEKKIK	ELKSRLQVLK	AQSEDPLPEL	HEDLHNEKEL
IKELEQSLAS	WTQNLKELQT	MKADLTRHVL	VEDVMVLKEQ	IEHLHRQWED
LCLRVAIRKQ	EIEDRLNTWV	VFNEKNKELC	AWLVQMENKV	LQTADISIEE
MIEKLQKDCM	EEINLFSENK	LQLKQMGDQL	IKASNKSRAA	EIDDKLNKIN
DRWQHLFDVI	GSRVKKLKET	FAFIQQLDKN	MSNLRTWLAR	IESELSKPVV
YDVCDDQEIQ	KRLAEQQDLQ	RDIEQHSAGV	ESVFNICDVL	LHDSDACANE
TECDSIQQTT	RSLDRRWRNI	CAMSMERRMK	IEETWRLWQK	FLDDYSRFED
WLKSAERTAA	CPNSSEVLYT	SAKEELKRFE	AFQRQIHERL	TQLELINKQY
RRLARENRTD	TASRLKQMVH	EGNQRWDNLQ	RRVTAVLRRL	RHFTNQREEF
EGTRESILVW	LTEMDLQLTN	VEHFSESDAD	DKMRQLNGFQ	QEITLNTNKI
DQLIVFGEQL	IQKSEPLDAV	LIEDELEELH	RYCQEVFGRV	SRFHRRLTSC
TPGLEDEKEA	SENETDMEDP	REIQTDSWRK	RGESEEPSSP	QSLCHLVAPG
HERSGCETPV	SVDSIPLEWD	HTGDVGGSSS	HEEDEEGPYY	SALSGKSISD
GHSWHVPDSP	SCPEHHYKQM	EGDRNVPPVP	PASSTPYKPP	YGKLLLPPGT
DGGKEGPRVL	NGNPQQEDGG	LAGITEQQSG	AFDRWEMIQA	QELHNKLKIK
QNLQQLNSDI	SAITTWLKKT	EAELEMLKMA	KPPSDIQEIE	LRVKRLQEIL
KAFDTYKALV	VSVNVSSKEF	LQTESPESTE	LQSRLRQLSL	LWEAAQGAVD
SWRGGLRQSL	MQCQDFHQLS	QNLLLWLASA	KNRRQKAHVT	DPKADPRALL
ECRRELMQLE	KELVERQPQV	DMLQEISNSL	LIKGHGEDCI	EAEEKVHVIE
KKLKQLREQV	SQDLMALQGT	QNPASPLPSF	DEVDSGDQPP	ATSVPAPRAK
QFRAVRTTEG	EEETESRVPG	STRPQRSFLS	RVVRAALPLQ	LLLLLLLLLA
CLLPSSEEDY	SCTQANNFAR	SFYPMLRYTN	GPPPT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, клітинних контактах, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Zhang Q., Ragnauth C., Greener M.J., Shanahan C.M., Roberts R.G. (2002). The nesprins are giant actin-binding proteins, orthologous to Drosophila melanogaster muscle protein MSP-300.. Genomics 80: 473 — 481. PubMed DOI:10.1006/geno.2002.6859
Rajgor D., Mellad J.A., Autore F., Zhang Q., Shanahan C.M. (2012). Multiple novel nesprin-1 and nesprin-2 variants act as versatile tissue-specific intracellular scaffolds.. PLoS ONE 7: E40098 — E40098. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0040098
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Schirmer E.C., Florens L., Guan T., Yates J.R. III, Gerace L. (2003). Nuclear membrane proteins with potential disease links found by subtractive proteomics.. Science 301: 1380 — 1382. PubMed DOI:10.1126/science.1088176
Stewart-Hutchinson P.J., Hale C.M., Wirtz D., Hodzic D. (2008). Structural requirements for the assembly of LINC complexes and their function in cellular mechanical stiffness.. Exp. Cell Res. 314: 1892 — 1905. PubMed DOI:10.1016/j.yexcr.2008.02.022
Luxton G.W., Gomes E.R., Folker E.S., Vintinner E., Gundersen G.G. (2010). Linear arrays of nuclear envelope proteins harness retrograde actin flow for nuclear movement.. Science 329: 956 — 959. PubMed DOI:10.1126/science.1189072

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17084 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q8WXH0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17084 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8WXH0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.