TPR

TPR (англ. Translocated promoter region, nuclear basket protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 363 амінокислот, а молекулярна маса — 267 293[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAVLQQVLERTELNKLPKSVQNKLEKFLADQQSEIDGLKGRHEKFKVES
EQQYFEIEKRLSHSQERLVNETRECQSLRLELEKLNNQLKALTEKNKELE
IAQDRNIAIQSQFTRTKEELEAEKRDLIRTNERLSQELEYLTEDVKRLNE
KLKESNTTKGELQLKLDELQASDVSVKYREKRLEQEKELLHSQNTWLNTE
LKTKTDELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVSRLEEQMNGLKTSNEHL
QKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKS
NELTRAVEELHKLLKEAGEANKAIQDHLLEVEQSKDQMEKEMLEKIGRLE
KELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYN
AYVETQDQLLLEKLENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKA
VASLSVKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKQSSVLERDNRRMEIQVKDLSQQI
RVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQN
QRLLVALRELGETREREEQETTSSKITELQLKLESALTELEQLRKSRQHQ
MQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVAIPLHASSLDDVSLASTPKRPSTSQT
VSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKAENEKIQNEQLEKL
QEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLHERNQKLT
ATTQKQEQIINTMTQDLRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQ
QRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQRLSSQIEKLEHEISH
LKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTETNLHLNTKELLKNAQKE
IATLKQHLSNMEVQVASQSSQRTGKGQPSNKEDVDDLVSQLRQTEEQVND
LKERLKTSTSNVEQYQAMVTSLEESLNKEKQVTEEVRKNIEVRLKESAEF
QTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRRAIESMEQQLSELKKTLSSVQNEVQEA
LQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAK
EQVSKMASVRQHLEETTQKAESQLLECKASWEERERMLKDEVSKCVCRCE
DLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVASVKEGVQGPLNVSLSEEGKSQEQILEIL
RFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNAEREKVQ
VTAKTMAQHEELMKKTETMNVVMETNKMLREEKERLEQDLQQMQAKVRKL
ELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKKLLEEDVKRWKARNQHLVSQQKDPD
TEEYRKLLSEKEVHTKRIQQLTEEIGRLKAEIARSNASLTNNQNLIQSLK
EDLNKVRTEKETIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQYEELKA
QQDKVMETSAQSSGDHQEQHVSVQEMQELKETLNQAETKSKSLESQVENL
QKTLSEKETEARNLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDRTTQEEQLRQQITEKE
EKTRKAIVAAKSKIAHLAGVKDQLTKENEELKQRNGALDQQKDELDVRIT
ALKSQYEGRISRLERELREHQERHLEQRDEPQEPSNKVPEQQRQITLKTT
PASGERGIASTSDPPTANIKPTPVVSTPSKVTAAAMAGNKSTPRASIRPM
VTPATVTNPTTTPTATVMPTTQVESQEAMQSEGPVEHVPVFGSTSGSVRS
TSPNVQPSISQPILTVQQQTQATAFVQPTQQSHPQIEPANQELSSNIVEV
VQSSPVERPSTSTAVFGTVSATPSSSLPKRTREEEEDSTIEASDQVSDDT
VEMPLPKKLKSVTPVGTEEEVMAEESTDGEVETQVYNQDSQDSIGEGVTQ
GDYTPMEDSEETSQSLQIDLGPLQSDQQTTTSSQDGQGKGDDVIVIDSDD
EEEDDDENDGEHEDYEEDEEDDDDDEDDTGMGDEGEDSNEGTGSADGNDG
YEADDAEGGDGTDPGTETEESMGGGEGNHRAADSQNSGEGNTGAAESSFS
QEVSREQQPSSASERQAPRAPQSPRRPPHPLPPRLTIHAPPQELGPPVQR
IQMTRRQSVGRGLQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFA
EAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDMPQTSSSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFL
AHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESTTSDASEHASQSVPMVTTSTGT
LSTTNETATGDDGDEVFVEAESEGISSEAGLEIDSQQEEEPVQASDESDL
PSTSQDPPSSSSVDTSSSQPKPFRRVRLQTTLRQGVRGRQFNRQRGVSHA
MGGRGGINRGNIN
TPR
Ідентифікатори
Символи TPR, translocated promoter region, nuclear basket protein
Зовнішні ІД OMIM: 189940 MGI: 1922066 HomoloGene: 37753 GeneCards: TPR
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7175
108989
Ensembl
ENSG00000047410
ENSMUSG00000006005
UniProt
P12270
Q5SWX9
F6ZDS4
RefSeq (мРНК)
NM_003292
NM_133780
RefSeq (білок)
NP_003283
NP_598541
Локус (UCSC) Хр. 1: 186.31 – 186.38 Mb Хр. 1: 150.39 – 150.45 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, транспорт мРНК, транслокація. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

  • Cordes V.C., Reidenbach S., Rackwitz H.R., Franke W.W. (1997). Identification of protein p270/Tpr as a constitutive component of the nuclear pore complex-attached intranuclear filaments.. J. Cell Biol. 136: 515 — 529. PubMed DOI:10.1083/jcb.136.3.515
  • Soman N.R., Wogan G.N., Rhim J.S. (1990). TPR-MET oncogenic rearrangement: detection by polymerase chain reaction amplification of the transcript and expression in human tumor cell lines.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 738 — 742. PubMed DOI:10.1073/pnas.87.2.738
  • Cordes V.C., Hase M.E., Muller L. (1998). Molecular segments of protein Tpr that confer nuclear targeting and association with the nuclear pore complex.. Exp. Cell Res. 245: 43 — 56. PubMed DOI:10.1006/excr.1998.4246
  • Hase M.E., Kuznetsov N.V., Cordes V.C. (2001). Amino acid substitutions of coiled-coil protein Tpr abrogate anchorage to the nuclear pore complex but not parallel, in-register homodimerization.. Mol. Biol. Cell 12: 2433 — 2452. PubMed DOI:10.1091/mbc.12.8.2433
  • Shibata S., Matsuoka Y., Yoneda Y. (2002). Nucleocytoplasmic transport of proteins and poly(A)+ RNA in reconstituted Tpr-less nuclei in living mammalian cells.. Genes Cells 7: 421 — 434. PubMed DOI:10.1046/j.1365-2443.2002.00525.x
  • Frosst P., Guan T., Subauste C., Hahn K., Gerace L. (2002). Tpr is localized within the nuclear basket of the pore complex and has a role in nuclear protein export.. J. Cell Biol. 156: 617 — 630. PubMed DOI:10.1083/jcb.200106046

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12017 (англ.). Процитовано 28 лютого 2017.
  4. UniProt, P12270 (англ.). Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.