АпоЕ-рецептор 2

АпоЕ-рецептор 2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3A7Q
Ідентифікатори
Символи	LRP8, APOER2, HSZ75190, LRP-8, MCI1, low density lipoprotein receptor-related protein 8, LDL receptor related protein 8
Зовнішні ІД	OMIM: 602600 MGI: 1340044 HomoloGene: 31250 GeneCards: LRP8
Пов'язані генетичні захворювання
	myocardial infarction, susceptibility to[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• reelin receptor activity; • calcium ion binding; • apolipoprotein binding; • GO:0001948 protein binding; • kinesin binding; • high-density lipoprotein particle binding; • very-low-density lipoprotein particle receptor activity; • transmembrane signaling receptor activity; • low-density lipoprotein particle receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення; • receptor complex; • клітинна мембрана; • microtubule associated complex; • extracellular region; • Аксон; • neuronal cell body; • Дендрит (нейробіологія); • caveola;
Біологічний процес	• Ендоцитоз; • ammon gyrus development; • lipid metabolism; • cytokine-mediated signaling pathway; • cellular response to growth factor stimulus; • positive regulation of protein tyrosine kinase activity; • modulation of chemical synaptic transmission; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of dendrite development; • cellular response to cholesterol; • Протеоліз; • retinoid metabolic process; • reelin-mediated signaling pathway; • positive regulation of CREB transcription factor activity; • cerebral cortex development; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • positive regulation of dendritic spine morphogenesis; • Сигнальна трансдукція; • Рецептор-опосередкований ендоцитоз; • regulation of apoptotic process; • regulation of innate immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7804
	16975
	ENSG00000157193
	ENSMUSG00000028613
	Q14114
	Q924X6
	NM_001018054; NM_004631; NM_017522; NM_033300
NM_001080926; NM_053073; NM_001369051; NM_001369052; NM_001369053;
	NM_001369054
	NP_001018064; NP_004622; NP_059992; NP_150643
NP_001074395; NP_001355980; NP_001355981; NP_001355982; NP_001355983;
	NP_444303
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

АпоЕ-рецептор 2, АпоЕ рецептор 2 типу (англ. LDL receptor related protein 8, ApoER2) – білок, який кодується геном LRP8, розташованим у людини на короткому плечі 1-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 105 634[5]. Рецептор, що належить до родини рецепторів ліпопротеїнів низької щільності (англ. Low density lipoprotein receptor gene family) та виявляється переважно в мозку і плаценті. ApoER2 складається з п'яти функціональних доменів, подібно до інших білків своєї родини.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLPEPGPLR	LLALLLLLLL	LLLLQLQHLA	AAAADPLLGG	QGPAKDCEKD
QFQCRNERCI	PSVWRCDEDD	DCLDHSDEDD	CPKKTCADSD	FTCDNGHCIH
ERWKCDGEEE	CPDGSDESEA	TCTKQVCPAE	KLSCGPTSHK	CVPASWRCDG
EKDCEGGADE	AGCATLCAPH	EFQCGNRSCL	AAVFVCDGDD	DCGDGSDERG
CADPACGPRE	FRCGGDGGGA	CIPERWVCDR	QFDCEDRSDE	AAELCGRPGP
GATSAPAACA	TASQFACRSG	ECVHLGWRCD	GDRDCKDKSD	EADCPLGTCR
GDEFQCGDGT	CVLAIKHCNQ	EQDCPDGSDE	AGCLQGLNEC	LHNNGGCSHI
CTDLKIGFEC	TCPAGFQLLD	QKTCGDIDEC	KDPDACSQIC	VNYKGYFKCE
CYPGYEMDLL	TKNCKAAAGK	SPSLIFTNRH	EVRRIDLVKR	NYSRLIPMLK
NVVALDVEVA	TNRIYWCDLS	YRKIYSAYMD	KASDPKEQEV	LIDEQLHSPE
GLAVDWVHKH	IYWTDSGNKT	ISVATVDGGR	RRTLFSRNLS	EPRAIAVDPL
RGFMYWSDWG	DQAKIEKSGL	NGVDRQTLVS	DNIEWPNGIT	LDLLSQRLYW
VDSKLHQLSS	IDFSGGNRKT	LISSTDFLSH	PFGIAVFEDK	VFWTDLENEA
IFSANRLNGL	EISILAENLN	NPHDIVIFHE	LKQPRAPDAC	ELSVQPNGGC
EYLCLPAPQI	SSHSPKYTCA	CPDTMWLGPD	MKRCYRAPQS	TSTTTLASTM
TRTVPATTRA	PGTTVHRSTY	QNHSTETPSL	TAAVPSSVSV	PRAPSISPST
LSPATSNHSQ	HYANEDSKMG	STVTAAVIGI	IVPIVVIALL	CMSGYLIWRN
WKRKNTKSMN	FDNPVYRKTT	EEEDEDELHI	GRTAQIGHVY	PAAISSFDRP
LWAEPCLGET	REPEDPAPAL	KELFVLPGEP	RSQLHQLPKN	PLSELPVVKS
KRVALSLEDD	GLP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, також секретований назовні.

ApoER2 здатний зв'язуватися з аполіпопротеїн E-вмісними ліпопротеїнами, але його основна виявлена функція — передача сигналу риліну. Білок рилін, його рецептори ApoER2 і VLDLR, і адаптерний білок цитоплазми DAB1 є учасниками єдиного сигнального шляху, що регулює правильну побудову шарів кори головного мозку. За відсутності обох рецепторів ApoER2 і VLDLR у мишей спостерігається фенотип reeler, такий же, як і за відсутності риліну. ApoER2 грає важливішу роль в сигнальному шляху риліну, оскільки при його відсутності спостерігаються серйозніші порушення міграції нейронів, чим за відсутності лише рецептора VLDLR.

Посилення довготривалої потенціації, що викликається риліном, також опосередковано рецептором ApoER2. Внутріклітинний домен рецептора, що кодується екзоном 19, впливає на рецептор NMDA (NMDAR), що грає важливу роль в механізмах пам'яті і навчання. Точний механізм дії цього білка, проте, поки що невідомий. Передбачається, що ApoER2 утворює комплекси з NMDAR і білком PSD95. Екзон 19 схильний до альтернативному сплайсингу, причому відносна кількість рецепторів з екзоном 19 збільшується під час активності і зменшується під час сну. Відсутність екзона 19 у піддослідних мишей не порушує процес кортикогенезу, але приводить до порушення роботи пам'яті[6].

Див. також

Хромосома 1

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Sacre S.M., Stannard A.K., Owen J.S. (2003). Apolipoprotein E (apoE) isoforms differentially induce nitric oxide production in endothelial cells.. FEBS Lett. 540: 181 — 187. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(03)00261-8
Andersen O.M., Benhayon D., Curran T., Willnow T.E. (2003). Differential binding of ligands to the apolipoprotein E receptor 2.. Biochemistry 42: 9355 — 9364. PubMed DOI:10.1021/bi034475p
Li X., Kypreos K., Zanni E.E., Zannis V. (2003). Domains of apoE required for binding to apoE receptor 2 and to phospholipids: implications for the functions of apoE in the brain.. Biochemistry 42: 10406 — 10417. PubMed DOI:10.1021/bi027093c
Riddell D.R., Vinogradov D.V., Stannard A.K., Chadwick N., Owen J.S. (1999). Identification and characterization of LRP8 (apoER2) in human blood platelets.. J. Lipid Res. 40: 1925 — 1930. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з АпоЕ-рецептор 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6700 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.
UniProt, Q14114 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.
Beffert U, Weeber EJ, Durudas A, Qiu S, Masiulis I, Sweatt JD, Li WP, Adelmann G, Frotscher M, Hammer RE, Herz J. Modulation of synaptic plasticity and memory by Reelin involves differential splicing of the lipoprotein receptor Apoer2. Neuron . 2005 Aug 18 ; 47(4):567-79. PMID 16102539 free full text PDF Архівовано 30 вересня 2007 у Wayback Machine.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з АпоЕ-рецептор 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6700 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

[UniProt-5] UniProt, Q14114 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

[Reelin_ApoER2_Exon19_2005_Beffert-6] Beffert U, Weeber EJ, Durudas A, Qiu S, Masiulis I, Sweatt JD, Li WP, Adelmann G, Frotscher M, Hammer RE, Herz J. Modulation of synaptic plasticity and memory by Reelin involves differential splicing of the lipoprotein receptor Apoer2. Neuron . 2005 Aug 18 ; 47(4):567-79. PMID 16102539 free full text PDF Архівовано 30 вересня 2007 у Wayback Machine.