Прото-онкоген RET

Прото-онкоген RET
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2IVS, 2IVT, 2IVU, 2IVV, 2X2K, 2X2L, 2X2M, 2X2U, 4CKI, 4CKJ, 4UX8, 5AMN
Ідентифікатори
Символи	RET, Ret, PTC, RET51, RET9, c-Ret, CDHF12, CDHR16, HSCR1, MEN2A, MEN2B, MTC1, RET-ELE1, ret proto-oncogene
Зовнішні ІД	OMIM: 164761 MGI: 97902 HomoloGene: 7517 GeneCards: RET
Пов'язані генетичні захворювання
	колоректальний рак, familial medullary thyroid carcinoma, Множинна ендокринна неоплазія тип 2Б, Феохромоцитома, Множинна ендокринна неоплазія тип 2А, hereditary pheochromocytoma-paraganglioma[1]
Реагує на сполуку
	linifanib, ponatinib, сорафеніб, сунітиніб, vandetanib[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • calcium ion binding; • protein kinase activity; • kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • signaling receptor activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • receptor tyrosine kinase; • transmembrane signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Ендосома; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • receptor complex; • integral component of plasma membrane; • Аксон; • neuronal cell body; • Дендрит (нейробіологія); • early endosome; • membrane raft; • endosome membrane; • клітинна мембрана; • гіалоплазма; • plasma membrane protein complex; • цитоплазма;
Біологічний процес	• cellular response to retinoic acid; • ureteric bud development; • embryonic epithelial tube formation; • membrane protein proteolysis; • фосфорилювання; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • positive regulation of cell migration; • neuron cell-cell adhesion; • нейробіологія розвитку; • neuron maturation; • positive regulation of metanephric glomerulus development; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of axonogenesis; • protein phosphorylation; • enteric nervous system development; • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • regulation of cell adhesion; • lymphocyte migration into lymphoid organs; • Адгезія клітин; • positive regulation of gene expression; • ureter maturation; • response to pain; • retina development in camera-type eye; • neural crest cell migration; • neuron differentiation; • positive regulation of cell size; • positive regulation of neuron projection development; • posterior midgut development; • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin; • іннервація; • positive regulation of neuron maturation; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • Сигнальна трансдукція; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • Peyer's patch morphogenesis; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • MAPK cascade; • axon guidance; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein; • glial cell-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; • positive regulation of MAPK cascade; • positive regulation of protein kinase B signaling; • negative regulation of signal transduction; • Диференціація клітин; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • neurogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5979
	19713
	ENSG00000165731
	ENSMUSG00000030110
	P07949
	P35546
	NM_000323; NM_020629; NM_020630; NM_020975; NM_001355216
	NM_001080780; NM_009050
	NP_065681; NP_066124; NP_001342145; NP_066124.1
	NP_001074249; NP_033076
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Прото-онкоген RET (англ. Ret proto-oncogene) – білок, який кодується геном RET, розташованим у людини на довгому плечі 10-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 114 амінокислот, а молекулярна маса — 124 319[6]. Цей білок належить до рецепторних тирозинкіназ, членів GDNF-родини лігандів (англ. glial cell line-derived neurotrophic factor family). RET знаходиться в позаклітинному просторі, девпливає на регуляцію сигнальних шляхів ERK, PI3K.[7]

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKATSGAAG	LRLLLLLLLP	LLGKVALGLY	FSRDAYWEKL	YVDQAAGTPL
LYVHALRDAP	EEVPSFRLGQ	HLYGTYRTRL	HENNWICIQE	DTGLLYLNRS
LDHSSWEKLS	VRNRGFPLLT	VYLKVFLSPT	SLREGECQWP	GCARVYFSFF
NTSFPACSSL	KPRELCFPET	RPSFRIRENR	PPGTFHQFRL	LPVQFLCPNI
SVAYRLLEGE	GLPFRCAPDS	LEVSTRWALD	REQREKYELV	AVCTVHAGAR
EEVVMVPFPV	TVYDEDDSAP	TFPAGVDTAS	AVVEFKRKED	TVVATLRVFD
ADVVPASGEL	VRRYTSTLLP	GDTWAQQTFR	VEHWPNETSV	QANGSFVRAT
VHDYRLVLNR	NLSISENRTM	QLAVLVNDSD	FQGPGAGVLL	LHFNVSVLPV
SLHLPSTYSL	SVSRRARRFA	QIGKVCVENC	QAFSGINVQY	KLHSSGANCS
TLGVVTSAED	TSGILFVNDT	KALRRPKCAE	LHYMVVATDQ	QTSRQAQAQL
LVTVEGSYVA	EEAGCPLSCA	VSKRRLECEE	CGGLGSPTGR	CEWRQGDGKG
ITRNFSTCSP	STKTCPDGHC	DVVETQDINI	CPQDCLRGSI	VGGHEPGEPR
GIKAGYGTCN	CFPEEEKCFC	EPEDIQDPLC	DELCRTVIAA	AVLFSFIVSV
LLSAFCIHCY	HKFAHKPPIS	SAEMTFRRPA	QAFPVSYSSS	GARRPSLDSM
ENQVSVDAFK	ILEDPKWEFP	RKNLVLGKTL	GEGEFGKVVK	ATAFHLKGRA
GYTTVAVKML	KENASPSELR	DLLSEFNVLK	QVNHPHVIKL	YGACSQDGPL
LLIVEYAKYG	SLRGFLRESR	KVGPGYLGSG	GSRNSSSLDH	PDERALTMGD
LISFAWQISQ	GMQYLAEMKL	VHRDLAARNI	LVAEGRKMKI	SDFGLSRDVY
EEDSYVKRSQ	GRIPVKWMAI	ESLFDHIYTT	QSDVWSFGVL	LWEIVTLGGN
PYPGIPPERL	FNLLKTGHRM	ERPDNCSEEM	YRLMLQCWKQ	EPDKRPVFAD
ISKDLEKMMV	KRRDYLDLAA	STPSDSLIYD	DGLSEEETPL	VDCNNAPLPR
ALPSTWIENK	LYGMSDPNWP	GESPVPLTRA	DGTNTGFPRY	PNDSVYANWM
LSPSAAKLMD	TFDS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Ген

Ген RET розташований на короткому плечі 10-ї хромосоми на позиції 11.2 (10q11.2), складається з 21 екзону. Різноманітні аномалії (транслокації (перестановки), мутації), що можуть виникати в RET, часто спостерігаються при медулярній та папілярній карциномах щитоподібної залози, феохромоцитомі та гіперплазії паращитоподібних залоз[8].

Роль RET під час розвитку організму

Трансдукція сигналів RET відіграє важливу роль в нормальному розвитку нирки та ентеральної нервової системи[9], частини периферійної нервової системи, яка регулює діяльність гладенької мускулатури.

Див. також

Хромосома 10

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Takahashi M., Cooper G.M. (1987). ret transforming gene encodes a fusion protein homologous to tyrosine kinases.. Mol. Cell. Biol. 7: 1378 — 1385. PubMed DOI:10.1128/MCB.7.4.1378
Corvi R., Berger N., Balczon R., Romeo G. (2000). RET/PCM-1: a novel fusion gene in papillary thyroid carcinoma.. Oncogene 19: 4236 — 4242. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1203772
Klugbauer S., Rabes H.M. (1999). The transcription coactivator HTIF1 and a related protein are fused to the RET receptor tyrosine kinase in childhood papillary thyroid carcinomas.. Oncogene 18: 4388 — 4393. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1202824
Graham Robinett R., Freemerman A.J., Skinner M.A., Shewchuk L., Lackey K. (2007). The discovery of substituted 4-(3-hydroxyanilino)-quinolines as potent RET kinase inhibitors.. Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 5886 — 5893. PubMed DOI:10.1016/j.bmcl.2007.07.104
Tsui C.C., Pierchala B.A. (2008). CD2AP and Cbl-3/Cbl-c constitute a critical checkpoint in the regulation of ret signal transduction.. J. Neurosci. 28: 8789 — 8800. PubMed DOI:10.1523/JNEUROSCI.2738-08.2008

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9967 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.
UniProt, P07949 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.
Knowles PP, Murray-Rust J. et al. (2006). Structure and chemical inhibition of the RET tyrosine kinase domain. J. Biol. Chem. 281 (44): 33577–87. PMID 16928683. doi:10.1074/jbc.M605604200.
База даних хвороб, які пов'язані з аномаліями в RET
Arighi E, Borrello MG, Sariola H. (2005). RET tyrosine kinase signaling in development and cancer. Cytokine Growth Factor Rev. 16 (4–5): 441–67. PMID 15982921. doi:10.1016/j.cytogfr.2005.05.010.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9967 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

[UniProt-6] UniProt, P07949 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

[knowles-7] Knowles PP, Murray-Rust J. et al. (2006). Structure and chemical inhibition of the RET tyrosine kinase domain. J. Biol. Chem. 281 (44): 33577–87. PMID 16928683. doi:10.1074/jbc.M605604200.

[8] База даних хвороб, які пов'язані з аномаліями в RET

[arighi-9] Arighi E, Borrello MG, Sariola H. (2005). RET tyrosine kinase signaling in development and cancer. Cytokine Growth Factor Rev. 16 (4–5): 441–67. PMID 15982921. doi:10.1016/j.cytogfr.2005.05.010.