BRAF

BRAF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UWH, 1UWJ, 2FB8, 2L05, 3C4C, 3D4Q, 3IDP, 3II5, 3NY5, 3OG7, 3PPJ, 3PPK, 3PRF, 3PRI, 3PSB, 3PSD, 3Q4C, 3Q96, 3SKC, 3TV4, 3TV6, 4DBN, 4E26, 4E4X, 4EHE, 4EHG, 4FC0, 4FK3, 4G9C, 4G9R, 4H58, 4JVG, 4KSP, 4KSQ, 4MBJ, 4MNE, 4MNF, 4PP7, 4WO5, 5C9C, 5CT7, 4XV2, 4XV1, 4XV9, 4XV3, 4R5Y, 5CSW, 5CSX, 4YHT, 5J2R, 5FD2, 5HIE, 5HID, 5HI2, 4CQE, 5J18
Ідентифікатори
Символи	BRAF, B-RAF1, BRAF1, NS7, RAFB1, B-Raf, B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 164757 MGI: 88190 HomoloGene: 3197 GeneCards: BRAF
Пов'язані генетичні захворювання
	колоректальний рак, Негоджкінська лімфома, Noonan syndrome 7[1]
Реагує на сполуку
	dabrafenib, регорафеніб, сорафеніб, вемурафеніб[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase activity; • calcium ion binding; • nucleotide binding; • transferase activity; • зв'язування з іоном металу; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • small GTPase binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • ATP binding; • MAP kinase kinase kinase activity; • mitogen-activated protein kinase kinase binding; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • клітинне ядро; • внутрішньоклітинний; • цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • мітохондрія; • neuron projection; • cell body;
Біологічний процес	• cellular response to calcium ion; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • фосфорилювання; • establishment of protein localization to membrane; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • protein phosphorylation; • animal organ morphogenesis; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of signal transduction; • positive regulation of glucose transmembrane transport; • trehalose metabolism in response to stress; • MAPK cascade; • positive regulation of gene expression; • Диференціація клітин; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • myeloid progenitor cell differentiation; • visual learning; • negative regulation of fibroblast migration; • thyroid gland development; • somatic stem cell population maintenance; • regulation of cell population proliferation; • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • positive T cell selection; • CD4-positive or CD8-positive, alpha-beta T cell lineage commitment; • response to peptide hormone; • negative regulation of neuron apoptotic process; • regulation of T cell differentiation; • alpha-beta T cell differentiation; • thymus development; • regulation of axon regeneration; • positive regulation of axon regeneration; • positive regulation of axonogenesis; • T cell receptor signaling pathway; • protein heterooligomerization; • positive regulation of stress fiber assembly; • response to cAMP; • long-term synaptic potentiation; • head morphogenesis; • face development; • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • negative regulation of synaptic vesicle exocytosis; • negative regulation of endothelial cell apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	673
	109880
	ENSG00000157764
	ENSMUSG00000002413
	P15056
	P28028
	NM_004333; NM_001354609; NM_001374244; NM_001374258
	NM_139294
NP_004324; NP_001341538; NP_001361173; NP_001361187; NP_001365396;
	NP_001365397; NP_001365398; NP_001365399; NP_001365400; NP_001365401; NP_001365402; NP_001365403; NP_001365404
	NP_647455
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BRAF, також відомий як протоонкоген B-Raf (англ. B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase) – білок, який кодується геном BRAF, розташованим у людей на довгому плечі 7-ї хромосоми.[5][6][7] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766 амінокислот, а молекулярна маса — 84 437[8]. BRAF впливає на нормальний ріст та диференціацію клітин та є складовою сигнального шляху MAPK/ERK.

Цей білок за функціями належить до серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAALSGGGGG	GAEPGQALFN	GDMEPEAGAG	AGAAASSAAD	PAIPEEVWNI
KQMIKLTQEH	IEALLDKFGG	EHNPPSIYLE	AYEEYTSKLD	ALQQREQQLL
ESLGNGTDFS	VSSSASMDTV	TSSSSSSLSV	LPSSLSVFQN	PTDVARSNPK
SPQKPIVRVF	LPNKQRTVVP	ARCGVTVRDS	LKKALMMRGL	IPECCAVYRI
QDGEKKPIGW	DTDISWLTGE	ELHVEVLENV	PLTTHNFVRK	TFFTLAFCDF
CRKLLFQGFR	CQTCGYKFHQ	RCSTEVPLMC	VNYDQLDLLF	VSKFFEHHPI
PQEEASLAET	ALTSGSSPSA	PASDSIGPQI	LTSPSPSKSI	PIPQPFRPAD
EDHRNQFGQR	DRSSSAPNVH	INTIEPVNID	DLIRDQGFRG	DGGSTTGLSA
TPPASLPGSL	TNVKALQKSP	GPQRERKSSS	SSEDRNRMKT	LGRRDSSDDW
EIPDGQITVG	QRIGSGSFGT	VYKGKWHGDV	AVKMLNVTAP	TPQQLQAFKN
EVGVLRKTRH	VNILLFMGYS	TKPQLAIVTQ	WCEGSSLYHH	LHIIETKFEM
IKLIDIARQT	AQGMDYLHAK	SIIHRDLKSN	NIFLHEDLTV	KIGDFGLATV
KSRWSGSHQF	EQLSGSILWM	APEVIRMQDK	NPYSFQSDVY	AFGIVLYELM
TGQLPYSNIN	NRDQIIFMVG	RGYLSPDLSK	VRSNCPKAMK	RLMAECLKKK
RDERPLFPQI	LASIELLARS	LPKIHRSASE	PSLNRAGFQT	EDFSLYACAS
PKTPIQAGGY	GAFPVH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Клінічне значення

Мутації в BRAF часто зустрічаються при меланомі, колоректальному раку та папілярному раку щитоподібної залози.[9]^,[10]^,[11]

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240
Eychene A., Barnier J.V., Apiou F., Dutrillaux B., Calothy G. (1992). Chromosomal assignment of two human B-raf(Rmil) proto-oncogene loci: B-raf-1 encoding the p94Braf/Rmil and B-raf-2, a processed pseudogene.. Oncogene 7: 1657 — 1660. PubMed
Sithanandam G., Kolch W., Duh F.-M., Rapp U.R. (1990). Complete coding sequence of a human B-raf cDNA and detection of B-raf protein kinase with isozyme specific antibodies.. Oncogene 5: 1775 — 1780. PubMed
Naoki K., Chen T.-H., Richards W.G., Sugarbaker D.J., Meyerson M. (2002). Missense mutations of the BRAF gene in human lung adenocarcinoma.. Cancer Res. 62: 7001 — 7003. PubMed
Hingorani S.R., Jacobetz M.A., Robertson G.P., Herlyn M., Tuveson D.A. (2003). Suppression of BRAF(V599E) in human melanoma abrogates transformation.. Cancer Res. 63: 5198 — 5202. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з BRAF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з BRAF (ген) переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1097 (англ.). Процитовано 12 лютого 2018.
Sithanandam G, Kolch W, Duh FM, Rapp UR (December 1990). Complete coding sequence of a human B-raf cDNA and detection of B-raf protein kinase with isozyme specific antibodies. Oncogene 5 (12): 1775–80. PMID 2284096.
Sithanandam G, Druck T, Cannizzaro LA, Leuzzi G, Huebner K, Rapp UR (April 1992). B-raf and a B-raf pseudogene are located on 7q in man. Oncogene 7 (4): 795–9. PMID 1565476.
UniProt, P15056 (англ.). Процитовано 12 лютого 2018.
King AJ, Patrick DR, Batorsky RS, Ho ML, Do HT, Zhang SY, Kumar R, Rusnak DW, Takle AK, Wilson DM, Hugger E, Wang L, Karreth F, Lougheed JC, Lee J, Chau D, Stout TJ, May EW, Rominger CM, Schaber MD, Luo L, Lakdawala AS, Adams JL, Contractor RG, Smalley KS, Herlyn M, Morrissey MM, Tuveson DA, Huang PS (December 2006). Demonstration of a genetic therapeutic index for tumors expressing oncogenic BRAF by the kinase inhibitor SB-590885. Cancer Res. 66 (23): 11100–5. PMID 17145850. doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-2554.
Tsai J, Lee JT, Wang W, Zhang J, Cho H, Mamo S, Bremer R, Gillette S, Kong J, Haass NK, Sproesser K, Li L, Smalley KS, Fong D, Zhu YL, Marimuthu A, Nguyen H, Lam B, Liu J, Cheung I, Rice J, Suzuki Y, Luu C, Settachatgul C, Shellooe R, Cantwell J, Kim SH, Schlessinger J, Zhang KY, West BL, Powell B, Habets G, Zhang C, Ibrahim PN, Hirth P, Artis DR, Herlyn M, Bollag G (February 2008). Discovery of a selective inhibitor of oncogenic B-Raf kinase with potent antimelanoma activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (8): 3041–6. PMC 2268581. PMID 18287029. doi:10.1073/pnas.0711741105.
Dinets A, Hulchiy M, Sofiadis A, Ghaderi M, Höög A, Larsson C, Zedenius J. (2012). Clinical, Genetic and Immunohistochemical Characterization of 70 Ukrainian Adult Cases with Post-Chornobyl Papillary Thyroid Carcinoma.. Eur J Endocrinol. Epub ahead of print. PMID 22457234. doi:10.1530/EJE-12-0144.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з BRAF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з BRAF (ген) переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1097 (англ.). Процитовано 12 лютого 2018.

[pmid2284096-6] Sithanandam G, Kolch W, Duh FM, Rapp UR (December 1990). Complete coding sequence of a human B-raf cDNA and detection of B-raf protein kinase with isozyme specific antibodies. Oncogene 5 (12): 1775–80. PMID 2284096.

[pmid1565476-7] Sithanandam G, Druck T, Cannizzaro LA, Leuzzi G, Huebner K, Rapp UR (April 1992). B-raf and a B-raf pseudogene are located on 7q in man. Oncogene 7 (4): 795–9. PMID 1565476.

[UniProt-8] UniProt, P15056 (англ.). Процитовано 12 лютого 2018.

[pmid17145850-9] King AJ, Patrick DR, Batorsky RS, Ho ML, Do HT, Zhang SY, Kumar R, Rusnak DW, Takle AK, Wilson DM, Hugger E, Wang L, Karreth F, Lougheed JC, Lee J, Chau D, Stout TJ, May EW, Rominger CM, Schaber MD, Luo L, Lakdawala AS, Adams JL, Contractor RG, Smalley KS, Herlyn M, Morrissey MM, Tuveson DA, Huang PS (December 2006). Demonstration of a genetic therapeutic index for tumors expressing oncogenic BRAF by the kinase inhibitor SB-590885. Cancer Res. 66 (23): 11100–5. PMID 17145850. doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-2554.

[pmid18287029-10] Tsai J, Lee JT, Wang W, Zhang J, Cho H, Mamo S, Bremer R, Gillette S, Kong J, Haass NK, Sproesser K, Li L, Smalley KS, Fong D, Zhu YL, Marimuthu A, Nguyen H, Lam B, Liu J, Cheung I, Rice J, Suzuki Y, Luu C, Settachatgul C, Shellooe R, Cantwell J, Kim SH, Schlessinger J, Zhang KY, West BL, Powell B, Habets G, Zhang C, Ibrahim PN, Hirth P, Artis DR, Herlyn M, Bollag G (February 2008). Discovery of a selective inhibitor of oncogenic B-Raf kinase with potent antimelanoma activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (8): 3041–6. PMC 2268581. PMID 18287029. doi:10.1073/pnas.0711741105.

[pmid17308849-11] Dinets A, Hulchiy M, Sofiadis A, Ghaderi M, Höög A, Larsson C, Zedenius J. (2012). Clinical, Genetic and Immunohistochemical Characterization of 70 Ukrainian Adult Cases with Post-Chornobyl Papillary Thyroid Carcinoma.. Eur J Endocrinol. Epub ahead of print. PMID 22457234. doi:10.1530/EJE-12-0144.