CRY1

CRY1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4CT0, 4K0R
Ідентифікатори
Символи	CRY1, cryptochrome circadian clock 1, PHLL1, DSPD, cryptochrome circadian regulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601933 MGI: 1270841 HomoloGene: 7042 GeneCards: CRY1
Пов'язані генетичні захворювання
	безсоння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity; • DNA binding; • nucleotide binding; • phosphatase binding; • blue light photoreceptor activity; • transcription factor binding; • histone deacetylase binding; • DNA (6-4) photolyase activity; • core promoter sequence-specific DNA binding; • kinase binding; • GO:0001948 protein binding; • photoreceptor activity; • double-stranded DNA binding; • protein kinase binding; • E-box binding; • lyase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мітохондрія; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• Глюконеогенез; • negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway; • response to glucagon; • regulation of transcription, DNA-templated; • glucose homeostasis; • response to stimulus; • ритмічний процес; • negative regulation of circadian rhythm; • lipid storage; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • response to insulin; • negative regulation of protein ubiquitination; • regulation of circadian rhythm; • regulation of DNA damage checkpoint; • DNA damage induced protein phosphorylation; • protein-chromophore linkage; • negative regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of glucocorticoid secretion; • entrainment of circadian clock by photoperiod; • blue light signaling pathway; • циркадний ритм; • negative regulation of gluconeogenesis; • positive regulation of protein ubiquitination; • response to light stimulus; • response to activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1407
	12952
	ENSG00000008405
	ENSMUSG00000020038
	Q16526
	P97784
	NM_004075
	NM_007771
	NP_004066; NP_004066.1
	NP_031797
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CRY1 (англ. Cryptochrome circadian clock 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 586 амінокислот, а молекулярна маса — 66 395[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGVNAVHWFR	KGLRLHDNPA	LKECIQGADT	IRCVYILDPW	FAGSSNVGIN
RWRFLLQCLE	DLDANLRKLN	SRLFVIRGQP	ADVFPRLFKE	WNITKLSIEY
DSEPFGKERD	AAIKKLATEA	GVEVIVRISH	TLYDLDKIIE	LNGGQPPLTY
KRFQTLISKM	EPLEIPVETI	TSEVIEKCTT	PLSDDHDEKY	GVPSLEELGF
DTDGLSSAVW	PGGETEALTR	LERHLERKAW	VANFERPRMN	ANSLLASPTG
LSPYLRFGCL	SCRLFYFKLT	DLYKKVKKNS	SPPLSLYGQL	LWREFFYTAA
TNNPRFDKME	GNPICVQIPW	DKNPEALAKW	AEGRTGFPWI	DAIMTQLRQE
GWIHHLARHA	VACFLTRGDL	WISWEEGMKV	FEELLLDADW	SINAGSWMWL
SCSSFFQQFF	HCYCPVGFGR	RTDPNGDYIR	RYLPVLRGFP	AKYIYDPWNA
PEGIQKVAKC	LIGVNYPKPM	VNHAEASRLN	IERMKQIYQQ	LSRYRGLGLL
ASVPSNPNGN	GGFMGYSAEN	IPGCSSSGSC	SQGSGILHYA	HGDSQQTHLL
KQGRSSMGTG	LSGGKRPSQE	EDTQSIGPKV	QRQSTN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, хромофором, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Griffin E.A. Jr., Staknis D., Weitz C.J. (1999). Light-independent role of CRY1 and CRY2 in the mammalian circadian clock.. Science 286: 768 — 771. PubMed DOI:10.1126/science.286.5440.768
Partch C.L., Shields K.F., Thompson C.L., Selby C.P., Sancar A. (2006). Posttranslational regulation of the mammalian circadian clock by cryptochrome and protein phosphatase 5.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 10467 — 10472. PubMed DOI:10.1073/pnas.0604138103
Ye R., Selby C.P., Ozturk N., Annayev Y., Sancar A. (2011). Biochemical analysis of the canonical model for the mammalian circadian clock.. J. Biol. Chem. 286: 25891 — 25902. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.254680
Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge.. Physiol. Rev. 93: 107 — 135. PubMed DOI:10.1152/physrev.00016.2012
Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock.. Trends Cell Biol. 24: 90 — 99. PubMed DOI:10.1016/j.tcb.2013.07.002

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CRY1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2384 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q16526 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CRY1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2384 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q16526 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.