TRPA1

TRPA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3J9P
Ідентифікатори
Символи	TRPA1, ANKTM1, FEPS, transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, FEPS1
Зовнішні ІД	OMIM: 604775 MGI: 3522699 HomoloGene: 7189 GeneCards: TRPA1
Реагує на сполуку
	hexamethylene diisocyanate, Етаналь, Апоморфін, auranofin, 1,4-Бензохінон, benzyl bromide, Бромоацетон, O-chlorobenzylidenemalononitrile, chloropicrin, Дибензоксазепін, Дибутилфталат, methylglyoxal, methyl isocyanate, oleocanthal, 2-chloroacetophenone, озон, Тимол, Акролеїн, Аліцин, Тетрагідроканнабінол, URB597, Ментол[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• channel activity; • calcium-release channel activity; • ion channel activity; • temperature-gated cation channel activity; • calcium channel activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• stereocilium bundle; • integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• response to organic cyclic compound; • detection of chemical stimulus involved in sensory perception of pain; • response to stimulus; • ion transport; • response to organic substance; • cell surface receptor signaling pathway; • response to pain; • calcium ion transmembrane transport; • response to cold; • sensory perception of pain; • protein homotetramerization; • response to hydrogen peroxide; • thermoception; • calcium ion transport; • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • transmembrane transport; • ion transmembrane transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8989
	277328
	ENSG00000104321
	ENSMUSG00000032769
	O75762
	Q8BLA8
	NM_007332
	NM_177781; NM_001348288
	NP_015628
	NP_808449; NP_001335217
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRPA1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 119 амінокислот, а молекулярна маса — 127 501[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRSLRKMWR	PGEKKEPQGV	VYEDVPDDTE	DFKESLKVVF	EGSAYGLQNF
NKQKKLKRCD	DMDTFFLHYA	AAEGQIELME	KITRDSSLEV	LHEMDDYGNT
PLHCAVEKNQ	IESVKFLLSR	GANPNLRNFN	MMAPLHIAVQ	GMNNEVMKVL
LEHRTIDVNL	EGENGNTAVI	IACTTNNSEA	LQILLKKGAK	PCKSNKWGCF
PIHQAAFSGS	KECMEIILRF	GEEHGYSRQL	HINFMNNGKA	TPLHLAVQNG
DLEMIKMCLD	NGAQIDPVEK	GRCTAIHFAA	TQGATEIVKL	MISSYSGSVD
IVNTTDGCHE	TMLHRASLFD	HHELADYLIS	VGADINKIDS	EGRSPLILAT
ASASWNIVNL	LLSKGAQVDI	KDNFGRNFLH	LTVQQPYGLK	NLRPEFMQMQ
QIKELVMDED	NDGCTPLHYA	CRQGGPGSVN	NLLGFNVSIH	SKSKDKKSPL
HFAASYGRIN	TCQRLLQDIS	DTRLLNEGDL	HGMTPLHLAA	KNGHDKVVQL
LLKKGALFLS	DHNGWTALHH	ASMGGYTQTM	KVILDTNLKC	TDRLDEDGNT
ALHFAAREGH	AKAVALLLSH	NADIVLNKQQ	ASFLHLALHN	KRKEVVLTII
RSKRWDECLK	IFSHNSPGNK	CPITEMIEYL	PECMKVLLDF	CMLHSTEDKS
CRDYYIEYNF	KYLQCPLEFT	KKTPTQDVIY	EPLTALNAMV	QNNRIELLNH
PVCKEYLLMK	WLAYGFRAHM	MNLGSYCLGL	IPMTILVVNI	KPGMAFNSTG
IINETSDHSE	ILDTTNSYLI	KTCMILVFLS	SIFGYCKEAG	QIFQQKRNYF
MDISNVLEWI	IYTTGIIFVL	PLFVEIPAHL	QWQCGAIAVY	FYWMNFLLYL
QRFENCGIFI	VMLEVILKTL	LRSTVVFIFL	LLAFGLSFYI	LLNLQDPFSS
PLLSIIQTFS	MMLGDINYRE	SFLEPYLRNE	LAHPVLSFAQ	LVSFTIFVPI
VLMNLLIGLA	VGDIAEVQKH	ASLKRIAMQV	ELHTSLEKKL	PLWFLRKVDQ
KSTIVYPNKP	RSGGMLFHIF	CFLFCTGEIR	QEIPNADKSL	EMEILKQKYR
LKDLTFLLEK	QHELIKLIIQ	KMEIISETED	DDSHCSFQDR	FKKEQMEQRN
SRWNTVLRAV	KAKTHHLEP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Jaquemar D., Schenker T., Trueb B. (1999). An ankyrin-like protein with transmembrane domains is specifically lost after oncogenic transformation of human fibroblasts.. J. Biol. Chem. 274: 7325 — 7333. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.11.7325
Paulsen C.E., Armache J.P., Gao Y., Cheng Y., Julius D. (2015). Structure of the TRPA1 ion channel suggests regulatory mechanisms.. Nature 520: 511 — 517. PubMed DOI:10.1038/nature14367

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:497 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, O75762 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:497 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O75762 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.