FGFR1

FGFR1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AGW, 1CVS, 1EVT, 1FGI, 1FGK, 1FQ9, 1XR0, 2CR3, 2FGI, 3C4F, 3DPK, 3GQI, 3GQL, 3JS2, 3KRJ, 3KRL, 3KXX, 3KY2, 3RHX, 3TT0, 4F63, 4F64, 4F65, 4NK9, 4NKA, 4NKS, 4RWI, 4RWJ, 4RWK, 4RWL, 4UWY, 4WUN, 5AM6, 5AM7, 4ZSA, 5A4C, 4UWB, 4UWC, 5A46, 5FLF, 5EW8, 5B7V
Ідентифікатори
Символи	FGFR1, BFGFR, CD331, CEK, FGFBR, FGFR-1, FLG, FLT-2, FLT2, HBGFR, HH2, HRTFDS, KAL2, N-SAM, OGD, bFGF-R-1, ECCL, fibroblast growth factor receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 136350 MGI: 95522 HomoloGene: 69065 GeneCards: FGFR1
Пов'язані генетичні захворювання
	osteoglophonic dwarfism, Hartsfield-Bixler-Demyer syndrome, Encephalocraniocutaneous lipomatosis, Jackson–Weiss syndrome, Pfeiffer syndrome type 1[1]
Реагує на сполуку
	Нінтеданіб, Пазопаніб, сорафеніб, сунітиніб[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• kinase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • protein kinase activity; • transferase activity; • protein homodimerization activity; • GO:0001948 protein binding; • nucleotide binding; • identical protein binding; • fibroblast growth factor binding; • fibroblast growth factor-activated receptor activity; • heparin binding; • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity; • protein tyrosine kinase activity; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity; • receptor-receptor interaction; • receptor tyrosine kinase; • transmembrane signaling receptor activity; • SH2 domain binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • extracellular region; • клітинне ядро; • receptor complex; • integral component of plasma membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинна мембрана; • integral component of membrane; • Ядерце;
Біологічний процес	• skeletal system development; • ureteric bud development; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway involved in orbitofrontal cortex development; • positive regulation of endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor; • positive regulation of MAP kinase activity; • positive regulation of phospholipase C activity; • regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis by mesenchymal-epithelial signaling; • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation; • mesenchymal cell differentiation; • positive regulation of mesenchymal cell proliferation; • Ангіогенез; • orbitofrontal cortex development; • positive regulation of MAPKKK cascade by fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • branching involved in salivary gland morphogenesis; • regulation of transcription, DNA-templated; • blood vessel morphogenesis; • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • lung development; • in utero embryonic development; • cell maturation; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell cycle; • embryonic limb morphogenesis; • positive regulation of neuron differentiation; • protein autophosphorylation; • auditory receptor cell development; • positive regulation of MAPK cascade; • paraxial mesoderm development; • chondrocyte differentiation; • organ induction; • фосфорилювання; • ventricular zone neuroblast division; • skeletal system morphogenesis; • neuron migration; • outer ear morphogenesis; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • middle ear morphogenesis; • Регуляція експресії генів; • phosphatidylinositol-mediated signaling; • midbrain development; • chordate embryonic development; • sensory perception of sound; • salivary gland morphogenesis; • generation of neurons; • MAPK cascade; • regulation of lateral mesodermal cell fate specification; • positive regulation of phospholipase activity; • brain development; • regulation of cell population proliferation; • inner ear morphogenesis; • positive regulation of neuron projection development; • regulation of cell differentiation; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • lung-associated mesenchyme development; • cell migration; • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process; • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process; • protein phosphorylation; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of parathyroid hormone secretion; • negative regulation of fibroblast growth factor production; • vitamin D3 metabolic process; • regulation of phosphorus metabolic process; • positive regulation of mitotic cell cycle DNA replication; • positive regulation of protein kinase B signaling; • regulation of phosphate transport; • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation; • ear development; • negative regulation of signal transduction; • Диференціація клітин; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • нейробіологія розвитку; • positive regulation of cell differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2260
	14182
	ENSG00000077782
	ENSMUSG00000031565
	P11362
	P16092
NM_001174063; NM_001174064; NM_001174065; NM_001174066; NM_001174067;
	NM_015850; NM_023105; NM_023106; NM_023107; NM_023108; NM_023109; NM_023110; NM_023111; NM_032191; NM_001354367; NM_001354368; NM_001354369; NM_001354370
	NM_001079908; NM_001079909; NM_010206
NP_001167534; NP_001167535; NP_001167536; NP_001167537; NP_001167538;
	NP_056934; NP_075593; NP_075594; NP_075598; NP_001341296; NP_001341297; NP_001341298; NP_001341299
	NP_001073377; NP_001073378; NP_034336
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FGFR1 (англ. Fibroblast growth factor receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 822 амінокислот, а молекулярна маса — 91 868[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWSWKCLLFW	AVLVTATLCT	ARPSPTLPEQ	AQPWGAPVEV	ESFLVHPGDL
LQLRCRLRDD	VQSINWLRDG	VQLAESNRTR	ITGEEVEVQD	SVPADSGLYA
CVTSSPSGSD	TTYFSVNVSD	ALPSSEDDDD	DDDSSSEEKE	TDNTKPNRMP
VAPYWTSPEK	MEKKLHAVPA	AKTVKFKCPS	SGTPNPTLRW	LKNGKEFKPD
HRIGGYKVRY	ATWSIIMDSV	VPSDKGNYTC	IVENEYGSIN	HTYQLDVVER
SPHRPILQAG	LPANKTVALG	SNVEFMCKVY	SDPQPHIQWL	KHIEVNGSKI
GPDNLPYVQI	LKTAGVNTTD	KEMEVLHLRN	VSFEDAGEYT	CLAGNSIGLS
HHSAWLTVLE	ALEERPAVMT	SPLYLEIIIY	CTGAFLISCM	VGSVIVYKMK
SGTKKSDFHS	QMAVHKLAKS	IPLRRQVTVS	ADSSASMNSG	VLLVRPSRLS
SSGTPMLAGV	SEYELPEDPR	WELPRDRLVL	GKPLGEGCFG	QVVLAEAIGL
DKDKPNRVTK	VAVKMLKSDA	TEKDLSDLIS	EMEMMKMIGK	HKNIINLLGA
CTQDGPLYVI	VEYASKGNLR	EYLQARRPPG	LEYCYNPSHN	PEEQLSSKDL
VSCAYQVARG	MEYLASKKCI	HRDLAARNVL	VTEDNVMKIA	DFGLARDIHH
IDYYKKTTNG	RLPVKWMAPE	ALFDRIYTHQ	SDVWSFGVLL	WEIFTLGGSP
YPGVPVEELF	KLLKEGHRMD	KPSNCTNELY	MMMRDCWHAV	PSQRPTFKQL
VEDLDRIVAL	TSNQEYLDLS	MPLDQYSPSF	PDTRSSTCSS	GEDSVFSHEP
LPEEPCLPRH	PAQLANGGLK	RR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, з молекулою гепарину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

Itoh N., Terachi T., Ohta M., Seo M.K. (1990). The complete amino acid sequence of the shorter form of human basic fibroblast growth factor receptor deduced from its cDNA.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 169: 680 — 685. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(90)90384-Y
Johnson D.E., Lee P.L., Lu J., Williams L.T. (1990). Diverse forms of a receptor for acidic and basic fibroblast growth factors.. Mol. Cell. Biol. 10: 4728 — 4736. PubMed DOI:10.1128/MCB.10.9.4728
Isacchi A., Bergonzoni L., Sarmientos P. (1990). Complete sequence of a human receptor for acidic and basic fibroblast growth factors.. Nucleic Acids Res. 18: 1906 — 1906. PubMed DOI:10.1093/nar/18.7.1906
Wennstroem S., Sandstroem C., Claesson-Welsh L. (1991). cDNA cloning and expression of a human FGF receptor which binds acidic and basic FGF.. Growth Factors 4: 197 — 208. PubMed DOI:10.3109/08977199109104816
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Johnson D.E., Lu J., Chen H., Werner S., Williams L.T. (1991). The human fibroblast growth factor receptor genes: a common structural arrangement underlies the mechanisms for generating receptor forms that differ in their third immunoglobulin domain.. Mol. Cell. Biol. 11: 4627 — 4634. PubMed DOI:10.1128/MCB.11.9.4627

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з FGFR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Fibroblast growth factor receptor 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3688 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P11362 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з FGFR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Fibroblast growth factor receptor 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3688 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P11362 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.