Глюкокортикоїдний рецептор

NR3C1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1M2Z, 1NHZ, 1P93, 3BQD, 3CLD, 3E7C, 3H52, 3K22, 3K23, 4CSJ, 4HN5, 4HN6, 4LSJ, 4MDD, 4P6W, 4P6X, 5CBY, 5CBX, 4UDC, 4UDD, 5CBZ, 5CC1, 5EMQ, 5EMC, 5EMP
Ідентифікатори
Символи	NR3C1, GCCR, GCR, GCRST, GR, GRL, nuclear receptor subfamily 3 group C member 1, Glucocorticoid Receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 138040 MGI: 95824 HomoloGene: 30960 GeneCards: NR3C1
Пов'язані генетичні захворювання
	glucocorticoid resistance[1]
Реагує на сполуку
	Будесонід, ciclesonide, clobetasol propionate, Кортизол, desoxycortone, desoximetasone, дексаметазон, difluprednate, fluocinolone acetonide, fluocinonide, fluorometholone, флутіказон, fluticasone propionate, Метилпреднізолон, преднізолон, преднізон, RU28362, Триамцинолон, triamcinolone acetonide, betamethasone, Міфепристон[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• steroid hormone binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • glucocorticoid receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • steroid hormone receptor activity; • steroid binding; • GO:0001948 protein binding; • lipid binding; • RNA binding; • SUMO binding; • Hsp90 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • protein kinase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Нуклеоплазма; • мітохондріальний матрикс; • мітохондрія; • клітинне ядро; • Цитоскелет; • Веретено поділу; • Центр організації мікротрубочок; • гіалоплазма; • nuclear speck; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• cellular response to steroid hormone stimulus; • regulation of transcription, DNA-templated; • glucocorticoid mediated signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • glucocorticoid receptor signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • steroid hormone mediated signaling pathway; • Клітинний цикл; • поділ клітини; • Апоптоз; • chromosome segregation; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • cellular response to dexamethasone stimulus; • cellular response to transforming growth factor beta stimulus; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to glucocorticoid stimulus; • chromatin organization; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2908
	14815
	ENSG00000113580
	ENSMUSG00000024431
	P04150; Q3MSN4
	P06537
NM_000176; NM_001018074; NM_001018075; NM_001018076; NM_001018077;
	NM_001020825; NM_001024094; NM_001204258; NM_001204259; NM_001204260; NM_001204261; NM_001204262; NM_001204263; NM_001204264; NM_001204265; NM_001364180; NM_001364181; NM_001364182; NM_001364183; NM_001364184; NM_001364185
	NM_008173; NM_001361209; NM_001361210; NM_001361211; NM_001361212
NP_000167; NP_001018084; NP_001018085; NP_001018086; NP_001018087;
	NP_001018661; NP_001019265; NP_001191187; NP_001191188; NP_001191189; NP_001191190; NP_001191191; NP_001191192; NP_001191193; NP_001191194; NP_001351109; NP_001351110; NP_001351111; NP_001351112; NP_001351113; NP_001351114; NP_000167.1; NP_001018084.1; NP_001018085.1; NP_001018086.1; NP_001018087.1; NP_001018661.1; NP_001019265.1; NP_001191187.1; NP_001191188.1; NP_001191189.1; NP_001191190.1; NP_001191191.1; NP_001191192.1; NP_001191193.1
	NP_001348138; NP_001348139; NP_001348140; NP_001348141; NP_032199
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR3C1 (англ. Nuclear receptor subfamily 3 group C member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 777 амінокислот, а молекулярна маса — 85 659[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSKESLTPG	REENPSSVLA	QERGDVMDFY	KTLRGGATVK	VSASSPSLAV
ASQSDSKQRR	LLVDFPKGSV	SNAQQPDLSK	AVSLSMGLYM	GETETKVMGN
DLGFPQQGQI	SLSSGETDLK	LLEESIANLN	RSTSVPENPK	SSASTAVSAA
PTEKEFPKTH	SDVSSEQQHL	KGQTGTNGGN	VKLYTTDQST	FDILQDLEFS
SGSPGKETNE	SPWRSDLLID	ENCLLSPLAG	EDDSFLLEGN	SNEDCKPLIL
PDTKPKIKDN	GDLVLSSPSN	VTLPQVKTEK	EDFIELCTPG	VIKQEKLGTV
YCQASFPGAN	IIGNKMSAIS	VHGVSTSGGQ	MYHYDMNTAS	LSQQQDQKPI
FNVIPPIPVG	SENWNRCQGS	GDDNLTSLGT	LNFPGRTVFS	NGYSSPSMRP
DVSSPPSSSS	TATTGPPPKL	CLVCSDEASG	CHYGVLTCGS	CKVFFKRAVE
GQHNYLCAGR	NDCIIDKIRR	KNCPACRYRK	CLQAGMNLEA	RKTKKKIKGI
QQATTGVSQE	TSENPGNKTI	VPATLPQLTP	TLVSLLEVIE	PEVLYAGYDS
SVPDSTWRIM	TTLNMLGGRQ	VIAAVKWAKA	IPGFRNLHLD	DQMTLLQYSW
MFLMAFALGW	RSYRQSSANL	LCFAPDLIIN	EQRMTLPCMY	DQCKHMLYVS
SELHRLQVSY	EEYLCMKTLL	LLSSVPKDGL	KSQELFDEIR	MTYIKELGKA
IVKREGNSSQ	NWQRFYQLTK	LLDSMHEVVE	NLLNYCFQTF	LDKTMSIEFP
EMLAEIITNQ	IPKYSNGNIK	KLLFHQK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, розходження хромосом, поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК, стероїдами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мітохондрії.

Література

Turner J.D., Schote A.B., Keipes M., Muller C.P. (2007). A new transcript splice variant of the human glucocorticoid receptor: identification and tissue distribution of hGR Delta 313-338, an alternative exon 2 transactivation domain isoform.. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1095: 334 — 341. PubMed DOI:10.1196/annals.1397.037
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Govindan M.V., Pothier F., Leclerc S., Palaniswami R., Xie B. (1991). Human glucocorticoid receptor gene promotor-homologous down regulation.. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 40: 317 — 323. PubMed DOI:10.1016/0960-0760(91)90197-D
Weinberger C., Hollenberg S.M., Rosenfeld M.G., Evans R.M. (1985). Domain structure of human glucocorticoid receptor and its relationship to the v-erb-A oncogene product.. Nature 318: 670 — 672. PubMed DOI:10.1038/318670a0
Bamberger C.M., Bamberger A.M., de Castro M., Chrousos G.P. (1995). Glucocorticoid receptor beta, a potential endogenous inhibitor of glucocorticoid action in humans.. J. Clin. Invest. 95: 2435 — 2441. PubMed DOI:10.1172/JCI117943
Oakley R.H., Sar M., Cidlowski J.A. (1996). The human glucocorticoid receptor beta isoform. Expression, biochemical properties, and putative function.. J. Biol. Chem. 271: 9550 — 9559. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.16.9550

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з NR3C1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7978 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P04150 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NR3C1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7978 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P04150 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.