Рецептор ліпопротеїнів низької щільності

Рецептор ліпопротеїнів низької щільності
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AJJ, 1D2J, 1F5Y, 1HJ7, 1HZ8, 1I0U, 1IJQ, 1LDL, 1LDR, 1N7D, 1XFE, 2FCW, 2KRI, 2LGP, 2W2M, 2W2N, 2W2O, 2W2P, 2W2Q, 3BPS, 3GCW, 3GCX, 3M0C, 3SO6, 2M7P, 2MG9, 3P5B, 3P5C, 4NE9
Ідентифікатори
Символи	LDLR, FH, FHC, LDLCQ2, low density lipoprotein receptor, FHCL1
Зовнішні ІД	OMIM: 606945 MGI: 96765 HomoloGene: 55469 GeneCards: LDLR
Пов'язані генетичні захворювання
	abdominal aortic aneurysm, серцево-судинні захворювання, lipid metabolism disorder[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • clathrin heavy chain binding; • virus receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • protease binding; • identical protein binding; • very-low-density lipoprotein particle receptor activity; • low-density lipoprotein particle receptor activity; • low-density lipoprotein particle binding; • amyloid-beta binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • Ендосома; • late endosome; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • receptor complex; • клітинна мембрана; • apical part of cell; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • basolateral plasma membrane; • early endosome; • low-density lipoprotein particle; • clathrin-coated pit; • Лізосома; • PCSK9-LDLR complex; • endosome membrane; • external side of plasma membrane; • extracellular space; • endolysosome membrane; • sorting endosome; • внутрішньоклітинний; • somatodendritic compartment;
Біологічний процес	• positive regulation of triglyceride biosynthetic process; • regulation of phosphatidylcholine catabolic process; • steroid metabolic process; • lipid transport; • Ендоцитоз; • lipid metabolism; • phospholipid transport; • cholesterol transport; • cholesterol metabolic process; • lipoprotein catabolic process; • intestinal cholesterol absorption; • транспорт; • viral entry into host cell; • cholesterol homeostasis; • GO:0022415 viral process; • positive regulation of gene expression; • positive regulation of inflammatory response; • lipoprotein metabolic process; • cellular response to fatty acid; • negative regulation of gene expression; • membrane organization; • cholesterol import; • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus; • receptor-mediated endocytosis involved in cholesterol transport; • chylomicron remnant clearance; • low-density lipoprotein particle clearance; • Рецептор-опосередкований ендоцитоз; • Фагоцитоз; • Довготривала пам'ять; • plasma lipoprotein particle clearance; • high-density lipoprotein particle clearance; • regulation of protein metabolic process; • negative regulation of protein metabolic process; • response to caloric restriction; • negative regulation of astrocyte activation; • regulation of cholesterol metabolic process; • amyloid-beta clearance; • amyloid-beta clearance by cellular catabolic process; • negative regulation of microglial cell activation; • positive regulation of lysosomal protein catabolic process; • negative regulation of amyloid fibril formation; • artery morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3949
	16835
	ENSG00000130164
	ENSMUSG00000032193
	P01130
	P35951
NM_000527; NM_001195798; NM_001195799; NM_001195800; NM_001195802;
	NM_001195803
	NM_001252658; NM_001252659; NM_010700
	NP_000518; NP_001182727; NP_001182728; NP_001182729; NP_001182732
	NP_001239587; NP_001239588; NP_034830
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Рецептор ліпопротеїнів низької щільності (ЛПНЩ-рецептор, англ. Low density lipoprotein receptor, LDL Receptor) – білок, який кодується геном LDLR, розташованим у людини на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 860 амінокислот, а молекулярна маса — 95 376[5].

Цей білок забезпечує ендоцитоз ліпопротеїнів низької щільності, збагачених холестеролом. ЛПНЩ-рецептор є трансмембранним білком, що специфічно розпізнає апоВ-100 і апоЕ. За відкриття цього найважливішого рецептора ліпідного метаболізму Майкл Браун і Джозеф Голдштейн отримали Нобелівську премію з фізіології або медицини 1985 року. Це стало результатом їх робіт з родинної гіперхолестерінемії.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPWGWKLRW	TVALLLAAAG	TAVGDRCERN	EFQCQDGKCI	SYKWVCDGSA
ECQDGSDESQ	ETCLSVTCKS	GDFSCGGRVN	RCIPQFWRCD	GQVDCDNGSD
EQGCPPKTCS	QDEFRCHDGK	CISRQFVCDS	DRDCLDGSDE	ASCPVLTCGP
ASFQCNSSTC	IPQLWACDND	PDCEDGSDEW	PQRCRGLYVF	QGDSSPCSAF
EFHCLSGECI	HSSWRCDGGP	DCKDKSDEEN	CAVATCRPDE	FQCSDGNCIH
GSRQCDREYD	CKDMSDEVGC	VNVTLCEGPN	KFKCHSGECI	TLDKVCNMAR
DCRDWSDEPI	KECGTNECLD	NNGGCSHVCN	DLKIGYECLC	PDGFQLVAQR
RCEDIDECQD	PDTCSQLCVN	LEGGYKCQCE	EGFQLDPHTK	ACKAVGSIAY
LFFTNRHEVR	KMTLDRSEYT	SLIPNLRNVV	ALDTEVASNR	IYWSDLSQRM
ICSTQLDRAH	GVSSYDTVIS	RDIQAPDGLA	VDWIHSNIYW	TDSVLGTVSV
ADTKGVKRKT	LFRENGSKPR	AIVVDPVHGF	MYWTDWGTPA	KIKKGGLNGV
DIYSLVTENI	QWPNGITLDL	LSGRLYWVDS	KLHSISSIDV	NGGNRKTILE
DEKRLAHPFS	LAVFEDKVFW	TDIINEAIFS	ANRLTGSDVN	LLAENLLSPE
DMVLFHNLTQ	PRGVNWCERT	TLSNGGCQYL	CLPAPQINPH	SPKFTCACPD
GMLLARDMRS	CLTEAEAAVA	TQETSTVRLK	VSSTAVRTQH	TTTRPVPDTS
RLPGATPGLT	TVEIVTMSHQ	ALGDVAGRGN	EKKPSSVRAL	SIVLPIVLLV
FLCLGVFLLW	KNWRLKNINS	INFDNPVYQK	TTEDEVHICH	NQDGYSYPSR
QMVSLEDDVA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, транспорт ліпідів, ендоцитоз. Локалізований у клітинній мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, лізосомах, апараті Гольджі, ендосомах.

Див. також

Хромосома 19

Література

Suedhof T.C., Goldstein J.L., Brown M.S., Russell D.W. (1985). The LDL receptor gene: a mosaic of exons shared with different proteins.. Science 228: 815 — 822. PubMed DOI:10.1126/science.2988123
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Agnello V., Abel G., Elfahal M., Knight G.B., Zhang Q.X. (1999). Hepatitis C virus and other flaviviridae viruses enter cells via low density lipoprotein receptor.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 12766 — 12771. PubMed DOI:10.1073/pnas.96.22.12766
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry.. Nat. Biotechnol. 21: 660 — 666. PubMed DOI:10.1038/nbt827
Bartosch B., Dubuisson J., Cosset F.-L. (2003). Infectious hepatitis C virus pseudo-particles containing functional E1-E2 envelope protein complexes.. J. Exp. Med. 197: 633 — 642. PubMed DOI:10.1084/jem.20021756
Burden J.J., Sun X.-M., Garcia Garcia A.B., Soutar A.K. (2004). Sorting motifs in the intracellular domain of the low density lipoprotein receptor interact with a novel domain of sorting nexin-17.. J. Biol. Chem. 279: 16237 — 16245. PubMed DOI:10.1074/jbc.M313689200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Рецептор ліпопротеїнів низької щільності переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6547 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.
UniProt, P01130 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Рецептор ліпопротеїнів низької щільності переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6547 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

[UniProt-5] UniProt, P01130 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.